211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1111 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  100 
 
 
233 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0750065  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1370  hemolysin A  53.81 
 
 
238 aa  229  3e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0691  hemolysin A  51.59 
 
 
253 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0674  ribosomal RNA large subunit methyltransferase, FtsJ family  52.92 
 
 
240 aa  226  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0616  hemolysin A  51.78 
 
 
253 aa  225  4e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.516871  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2024  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  52.94 
 
 
237 aa  224  1e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0155981  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1081  hemolysin A  50.4 
 
 
253 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1564  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  51.48 
 
 
237 aa  218  5e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00909837  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1016  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  53.78 
 
 
245 aa  216  2e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1343  hemolysin A  52.94 
 
 
236 aa  198  5e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.070329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  37.3 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  35.78 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  35.78 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2966  hemolysin A  35.78 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.173623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  38.16 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  37.24 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  39 
 
 
272 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  36.17 
 
 
266 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  37.39 
 
 
270 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  40.53 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  36.17 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1124  hemolysin A  37.5 
 
 
310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  38.39 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  38.26 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0798  putative rRNA methylase  36.51 
 
 
257 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  38.53 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  35.17 
 
 
272 aa  126  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  35.83 
 
 
284 aa  125  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3916  regulatory protein, DeoR  38.59 
 
 
262 aa  125  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00126237  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  36.02 
 
 
267 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  34.89 
 
 
318 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  36.16 
 
 
282 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0688  hemolysin A  38.64 
 
 
263 aa  122  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000097723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  33.06 
 
 
285 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  36.99 
 
 
266 aa  122  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4439  hemolysin A  36.84 
 
 
272 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.104243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  35.12 
 
 
252 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  33.91 
 
 
265 aa  121  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  36.75 
 
 
270 aa  121  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  36.17 
 
 
268 aa  121  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  34.8 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  39.46 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  39.46 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  35.47 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  38.14 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  40.09 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  37.07 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  37.23 
 
 
276 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  36.89 
 
 
367 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3290  hemolysin A  34.89 
 
 
269 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0401  hemolysin A  34.89 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  34.62 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  33.76 
 
 
250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3486  hemolysin A  35.06 
 
 
252 aa  118  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.72701  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  38.43 
 
 
264 aa  118  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2357  hemolysin A  36.8 
 
 
276 aa  118  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347309  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  36.36 
 
 
252 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  36.04 
 
 
251 aa  118  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  34.58 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4074  hemolysin A  34.2 
 
 
272 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198624  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1448  hemolysin A  34.04 
 
 
253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.948802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  35.4 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  35.24 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6058  hemolysin A  34.48 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1138  hemolysin A  34.32 
 
 
249 aa  116  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.768192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  36.21 
 
 
257 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1515  hemolysin A  33.06 
 
 
271 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000301327 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2200  hemolysin A  35.81 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2480  hemolysin A  35.27 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127708  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0679  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  35.68 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  37.02 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  37.02 
 
 
246 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14230  hemolysin A  35.86 
 
 
280 aa  115  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  37.29 
 
 
267 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1516  hemolysin A  33.06 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.559805  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  35.8 
 
 
246 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  35.15 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  36.03 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1657  hemolysin A  32.76 
 
 
286 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0477677  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  35.94 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  36.23 
 
 
268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1911  hemolysin A  34.76 
 
 
281 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.258384 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  34.45 
 
 
279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4131  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  31.64 
 
 
332 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  35.9 
 
 
245 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1902  hemolysin A  34.32 
 
 
281 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.485461  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  37.39 
 
 
266 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0443  hemolysin A  36.4 
 
 
246 aa  111  7.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0606544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  36.05 
 
 
269 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  34.06 
 
 
264 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2155  hemolysin A  37.6 
 
 
247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482655  hitchhiker  0.00924028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  37.5 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4163  hemolysin A  38.94 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  34.36 
 
 
250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  34.06 
 
 
264 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3027  hemolysin A  33.92 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5441  hemolysin A  33.04 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  32.78 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13650  predicted rRNA methylase  33.76 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  34.63 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.68471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>