212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0042 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  100 
 
 
246 aa  488  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  74.49 
 
 
252 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  70.12 
 
 
251 aa  334  5.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  64.46 
 
 
246 aa  304  7e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  63.87 
 
 
264 aa  295  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  57.44 
 
 
252 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  52.94 
 
 
240 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  52.05 
 
 
250 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  54.2 
 
 
367 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  53.14 
 
 
257 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  49.18 
 
 
268 aa  234  8e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  52.72 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  48.77 
 
 
282 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  50.21 
 
 
266 aa  229  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  56.67 
 
 
260 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  45.93 
 
 
270 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  48.96 
 
 
279 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  48.13 
 
 
279 aa  226  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  48.96 
 
 
279 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  48.96 
 
 
279 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  47.3 
 
 
266 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  48.96 
 
 
279 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  48.96 
 
 
279 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  48.96 
 
 
279 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  48.96 
 
 
279 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  54.24 
 
 
252 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  48.55 
 
 
279 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  47.72 
 
 
279 aa  222  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  48.55 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  43.88 
 
 
271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  43.88 
 
 
271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  53.97 
 
 
264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  55.45 
 
 
227 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  51.05 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  46.64 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  50.84 
 
 
249 aa  219  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  49.37 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  51.63 
 
 
247 aa  218  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  46.84 
 
 
269 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  47.88 
 
 
269 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1047  hemolysin A  48.57 
 
 
251 aa  216  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.940085  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  50 
 
 
245 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  47.74 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  47.5 
 
 
282 aa  215  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  53.28 
 
 
272 aa  215  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  49.16 
 
 
269 aa  211  7e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  46.22 
 
 
272 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  44.03 
 
 
270 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  47.3 
 
 
242 aa  207  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  44.98 
 
 
278 aa  206  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  45.99 
 
 
276 aa  205  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  45.71 
 
 
269 aa  204  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  48.52 
 
 
276 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  48.52 
 
 
274 aa  203  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  51.64 
 
 
250 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  46.64 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  46.64 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  49.16 
 
 
279 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  48.15 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  51.65 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  43.8 
 
 
275 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  47.74 
 
 
270 aa  195  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  46.61 
 
 
267 aa  194  8.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  44.4 
 
 
288 aa  194  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  48.95 
 
 
255 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  47.26 
 
 
246 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  45.24 
 
 
252 aa  192  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  47.66 
 
 
277 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1441  hemolysin A  45.45 
 
 
276 aa  191  9e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  47.7 
 
 
250 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  44.31 
 
 
268 aa  190  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1020  hemolysin A  46.41 
 
 
246 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  46.91 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  43.85 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  46.91 
 
 
266 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  46.86 
 
 
250 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  40.82 
 
 
270 aa  188  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  40.93 
 
 
264 aa  188  7e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  45 
 
 
256 aa  188  9e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2155  hemolysin A  45.83 
 
 
247 aa  188  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482655  hitchhiker  0.00924028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08030  hemolysin A  46.67 
 
 
247 aa  187  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.193218  hitchhiker  0.000000581038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0777  hemolysin A  47.72 
 
 
251 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.850156  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0702  hemolysin A  40 
 
 
243 aa  187  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2875  hemolysin A  47.3 
 
 
248 aa  186  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  45.08 
 
 
246 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1098  hemolysin A  49.17 
 
 
246 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  45.12 
 
 
248 aa  185  7e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  41.7 
 
 
271 aa  184  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  47.13 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  44.03 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2697  hemolysin A  45.04 
 
 
248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  45.42 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  46.5 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0632  hemolysin A  46.67 
 
 
251 aa  182  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0985618  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  43.85 
 
 
252 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  50.42 
 
 
252 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  47.74 
 
 
249 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  40.23 
 
 
284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0454  hemolysin A  44.05 
 
 
253 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4461  hemolysin A  46.84 
 
 
246 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>