212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2834 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  100 
 
 		 250 aa  478  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2377  hemolysin A  83.95 
 
 		 250 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  66.67 
 
 		 250 aa  315  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  67.07 
 
 		 250 aa  314  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  69.26 
 
 		 249 aa  305  6e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  64.29 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3820  hemolysin A  68.22 
 
 		 263 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  54.1 
 
 		 256 aa  248  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  55.51 
 
 		 245 aa  248  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  57.92 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  54.58 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2155  hemolysin A  52.92 
 
 		 247 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482655  hitchhiker  0.00924028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4163  hemolysin A  60.08 
 
 		 266 aa  231  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0852  hemolysin A  55 
 
 		 244 aa  231  9e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349901  normal  0.605509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  56.02 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0777  hemolysin A  56.67 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.850156  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  52.65 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  46.12 
 
 		 266 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  53.88 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0632  hemolysin A  55.83 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0985618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1020  hemolysin A  53.5 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  50.83 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  52.8 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  52.63 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4461  hemolysin A  55.83 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  51.64 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  51.64 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  52.03 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  54.55 
 
 		 247 aa  215  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  51.48 
 
 		 367 aa  215  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  52.54 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  50.62 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  48.58 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  50.61 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  49.38 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  50.63 
 
 		 279 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  47.77 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  45.93 
 
 		 270 aa  208  7e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  47.56 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  47.97 
 
 		 253 aa  207  9e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  44.84 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  48.76 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  50.21 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  46.75 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  47.46 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0604  hemolysin A  48.58 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30581  normal  0.619961 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  48.13 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  48.56 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  43.98 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  46.18 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  45.16 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  45.16 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  45.16 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  45.16 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  49.39 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  45.16 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  47.21 
 
 		 240 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  47.2 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  43.22 
 
 		 269 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  47.56 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  44.76 
 
 		 279 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  45.16 
 
 		 279 aa  198  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  45.16 
 
 		 279 aa  198  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  44.76 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  44.35 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  41.83 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  40 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  44.13 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  44.13 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  48.35 
 
 		 282 aa  194  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  43.46 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  44.94 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  43.9 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  43.9 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  42.8 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  45.68 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  45.04 
 
 		 277 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  45.38 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0798  putative rRNA methylase  42.02 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0992  hemolysin A  44.94 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  47.66 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0653  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  43.33 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  43.51 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  52.38 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  45.7 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  44.58 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  53.16 
 
 		 227 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  49.59 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  44 
 
 		 275 aa  185  5e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  47.66 
 
 		 274 aa  185  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  47.39 
 
 		 285 aa  185  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1047  hemolysin A  44.44 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.940085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0401  hemolysin A  42.15 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  40.74 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  41.77 
 
 		 272 aa  181  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1098  hemolysin A  51.25 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  43.44 
 
 		 268 aa  180  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  45.12 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  42.51 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  44.76 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>