215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2377 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2377  hemolysin A  100 
 
 
250 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  83.95 
 
 
250 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  68.85 
 
 
250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  68.03 
 
 
250 aa  305  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  70.66 
 
 
249 aa  298  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  67.23 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3820  hemolysin A  69.62 
 
 
263 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  56.33 
 
 
256 aa  261  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  57.43 
 
 
264 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2155  hemolysin A  53.66 
 
 
247 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482655  hitchhiker  0.00924028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  54.51 
 
 
247 aa  232  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4163  hemolysin A  62.66 
 
 
266 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  54.32 
 
 
245 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  54.58 
 
 
246 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0852  hemolysin A  56.25 
 
 
244 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349901  normal  0.605509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  55.37 
 
 
246 aa  224  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  50.83 
 
 
251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  52.3 
 
 
246 aa  219  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  53.59 
 
 
367 aa  218  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  45.53 
 
 
266 aa  217  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  52.24 
 
 
246 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  47.97 
 
 
270 aa  217  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  50 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  48.99 
 
 
248 aa  215  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0632  hemolysin A  56.25 
 
 
251 aa  215  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0985618  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1020  hemolysin A  51.85 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  53.28 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  51.24 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  51.24 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  53.11 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  49.17 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  55.37 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  53.31 
 
 
267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  46.99 
 
 
279 aa  210  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0604  hemolysin A  50.21 
 
 
248 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30581  normal  0.619961 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0777  hemolysin A  54.58 
 
 
251 aa  209  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.850156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  46.67 
 
 
279 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  46.67 
 
 
279 aa  208  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  46.67 
 
 
279 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  46.99 
 
 
279 aa  208  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  46.67 
 
 
279 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  46.99 
 
 
279 aa  208  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  46.67 
 
 
279 aa  208  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  46.67 
 
 
276 aa  207  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  47.37 
 
 
277 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  46.27 
 
 
279 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  51.39 
 
 
249 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  53.94 
 
 
264 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  50.41 
 
 
257 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  46.27 
 
 
279 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  47.43 
 
 
282 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  47.39 
 
 
253 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  50.62 
 
 
276 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  44.27 
 
 
271 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  44.27 
 
 
271 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  47.3 
 
 
269 aa  204  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  47.58 
 
 
253 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  49.39 
 
 
267 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  48.94 
 
 
268 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  45.78 
 
 
279 aa  201  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4461  hemolysin A  52.92 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  48.94 
 
 
240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  43.95 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  48.98 
 
 
279 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  47.92 
 
 
267 aa  199  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  48.19 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  41.98 
 
 
269 aa  198  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  48.35 
 
 
271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  43.55 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0992  hemolysin A  46 
 
 
263 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  43.5 
 
 
267 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  43.5 
 
 
267 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  47.58 
 
 
253 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  48.76 
 
 
274 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  45.08 
 
 
277 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  48.45 
 
 
263 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  48.56 
 
 
267 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1098  hemolysin A  53.5 
 
 
246 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  49.15 
 
 
282 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  44.72 
 
 
268 aa  189  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1047  hemolysin A  46.44 
 
 
251 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.940085  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  45.68 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  41.91 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  42.64 
 
 
275 aa  189  4e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  40.82 
 
 
268 aa  188  7e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  43.32 
 
 
273 aa  187  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  53.31 
 
 
252 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  42.46 
 
 
288 aa  186  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  45.68 
 
 
271 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  47.5 
 
 
252 aa  185  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  40.25 
 
 
271 aa  185  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4131  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  44.09 
 
 
332 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  46.64 
 
 
269 aa  185  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  42.21 
 
 
272 aa  185  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  45.83 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  46.31 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  47.39 
 
 
252 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1226  hemolysin A  52.67 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  50.61 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1441  hemolysin A  46.27 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>