215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4163 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4163  hemolysin A  100 
 
 
266 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  60.74 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  59.92 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  58.57 
 
 
255 aa  253  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  60.08 
 
 
250 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  52.02 
 
 
256 aa  242  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  59.92 
 
 
249 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  54.39 
 
 
246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  52.48 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  54.25 
 
 
252 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3820  hemolysin A  61.02 
 
 
263 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  54.17 
 
 
245 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1020  hemolysin A  53.44 
 
 
246 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2377  hemolysin A  62.92 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  51.59 
 
 
246 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0777  hemolysin A  55.28 
 
 
251 aa  219  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.850156  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  54.29 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0632  hemolysin A  56.67 
 
 
251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0985618  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2155  hemolysin A  50.61 
 
 
247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482655  hitchhiker  0.00924028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  53.56 
 
 
264 aa  212  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  50.61 
 
 
246 aa  211  7.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  51.02 
 
 
251 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  52.32 
 
 
248 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0852  hemolysin A  54.58 
 
 
244 aa  210  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349901  normal  0.605509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  47.5 
 
 
266 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  50 
 
 
253 aa  208  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  47.04 
 
 
251 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  49.19 
 
 
246 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0992  hemolysin A  49.58 
 
 
263 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  51.04 
 
 
252 aa  202  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4461  hemolysin A  52.23 
 
 
246 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  49.59 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  50 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  50.81 
 
 
252 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  51.84 
 
 
272 aa  198  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  46.47 
 
 
277 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  50.63 
 
 
279 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  41.49 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  52.67 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  52.3 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0604  hemolysin A  50.83 
 
 
248 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30581  normal  0.619961 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  47.7 
 
 
240 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  44.63 
 
 
267 aa  193  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  44.63 
 
 
267 aa  193  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  47.92 
 
 
268 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  49.16 
 
 
271 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  45.8 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  49.79 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  47.9 
 
 
282 aa  189  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  49.79 
 
 
367 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  50 
 
 
253 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  41.88 
 
 
271 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  47.93 
 
 
276 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0401  hemolysin A  44.81 
 
 
250 aa  187  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  45.15 
 
 
270 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1047  hemolysin A  46.31 
 
 
251 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.940085  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3916  regulatory protein, DeoR  46.53 
 
 
262 aa  185  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00126237  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  47.66 
 
 
252 aa  184  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  47.81 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  47.06 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  46.19 
 
 
267 aa  183  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  48.74 
 
 
269 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  48.74 
 
 
269 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2966  hemolysin A  48.74 
 
 
269 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.173623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  46.1 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  42.68 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2981  hemolysin A  45.8 
 
 
249 aa  182  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  48.54 
 
 
257 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  46.67 
 
 
267 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  47.9 
 
 
268 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  41.53 
 
 
269 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3290  hemolysin A  47.06 
 
 
269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  51.05 
 
 
252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  46.48 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  45.42 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  42.26 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  42.21 
 
 
270 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  43.28 
 
 
277 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2875  hemolysin A  44.12 
 
 
248 aa  175  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  48.32 
 
 
274 aa  175  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  47.68 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  44.4 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0454  hemolysin A  45.2 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  41.3 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  41.7 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  41.7 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  41.7 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  40.57 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  40.57 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  41.7 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  41.7 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  41.3 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  47.93 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1441  hemolysin A  44.14 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  41.3 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  44.4 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  41.3 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  42.39 
 
 
269 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  45.19 
 
 
248 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  41.3 
 
 
279 aa  171  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>