209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3916 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3916  regulatory protein, DeoR  100 
 
 		 262 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00126237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3486  hemolysin A  49.2 
 
 		 252 aa  232  6e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.72701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1448  hemolysin A  49 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.948802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  47.43 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0653  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  45.39 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  47.45 
 
 		 263 aa  195  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3287  putative hemolysin  45.49 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  44.58 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  45.75 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  44.72 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0118  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  40.86 
 
 		 302 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0891926 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  41.8 
 
 		 367 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  43.78 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4131  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  40.73 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  43.5 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  43.5 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  48.24 
 
 		 249 aa  175  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0679  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  40.31 
 
 		 267 aa  176  5e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1516  hemolysin A  42.91 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.559805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  43.9 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  41.8 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  43.48 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0798  putative rRNA methylase  41.25 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  39.76 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  41.46 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  43.43 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  41.87 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  41.77 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  41.87 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  43.5 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  41.46 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  40.48 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  41.87 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  41.87 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  41.87 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  41.87 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  41.87 
 
 		 279 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  41.87 
 
 		 279 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  43.03 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  44.98 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  42.11 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  41.7 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  41.46 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  43.2 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0401  hemolysin A  40.24 
 
 		 250 aa  171  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  43.6 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  42.8 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  42.28 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  40 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1515  hemolysin A  42.34 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000301327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0490  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  38.44 
 
 		 358 aa  168  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  41.37 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0655  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  45.2 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  42.28 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  42.17 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  38.58 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2981  hemolysin A  43.82 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4163  hemolysin A  46.56 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  42.17 
 
 		 253 aa  165  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  43.37 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  40.96 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2200  hemolysin A  42.86 
 
 		 268 aa  165  9e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  42.29 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  42.68 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0992  hemolysin A  42.11 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  40.16 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  39.59 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  40.71 
 
 		 246 aa  162  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  41.27 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1340  hemolysin A  42.08 
 
 		 348 aa  162  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  43.43 
 
 		 247 aa  162  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  40.65 
 
 		 270 aa  160  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  41.9 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  42.17 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  39.44 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  41 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2357  hemolysin A  42.29 
 
 		 276 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347309  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  39.44 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  40.96 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  42.17 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  42.63 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  41.04 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  41.04 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  40.96 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2966  hemolysin A  41.04 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.173623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  41.43 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  44.98 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  37.74 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  37.74 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  40.24 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  42.23 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  39.85 
 
 		 251 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  38.21 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  40.57 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  41.83 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1124  hemolysin A  42.11 
 
 		 310 aa  156  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  40.24 
 
 		 267 aa  155  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  39.36 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  40.93 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  38.43 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>