209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4131 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4131  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  100 
 
 		 332 aa  669    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0490  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  73.16 
 
 		 358 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0653  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  64.96 
 
 		 273 aa  345  8e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  62.18 
 
 		 263 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0655  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  61.76 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0118  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  49.31 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0891926 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  51.27 
 
 		 273 aa  248  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3287  putative hemolysin  51.28 
 
 		 260 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0619  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  75.18 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.109735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0598  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  75.18 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  49.64 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3486  hemolysin A  42.91 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.72701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5918  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  73.79 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4059  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  73.1 
 
 		 333 aa  219  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1448  hemolysin A  43.01 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.948802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  40.07 
 
 		 271 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  40.07 
 
 		 271 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  42.59 
 
 		 271 aa  185  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  41.82 
 
 		 242 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  43.49 
 
 		 367 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3916  regulatory protein, DeoR  40.73 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00126237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  40.48 
 
 		 282 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  39.93 
 
 		 267 aa  176  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  39.93 
 
 		 267 aa  176  7e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  41.88 
 
 		 269 aa  175  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  40.37 
 
 		 279 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  40.37 
 
 		 279 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  40.37 
 
 		 279 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  40.37 
 
 		 279 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  39.93 
 
 		 250 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  37.55 
 
 		 266 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  40.71 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  40.37 
 
 		 279 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  37.02 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  42.8 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  41.7 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  40.86 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  40 
 
 		 279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  40 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  39.21 
 
 		 250 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  40.07 
 
 		 246 aa  172  7.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  40.69 
 
 		 257 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  37.32 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  41.16 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2981  hemolysin A  42.54 
 
 		 249 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1441  hemolysin A  40.07 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  39.71 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2302  hemolysin A  41.88 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  41.7 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  38.52 
 
 		 279 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  39.26 
 
 		 279 aa  169  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  39.26 
 
 		 279 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  41.03 
 
 		 252 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  37.23 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  37.78 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  38.52 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1515  hemolysin A  40.07 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000301327 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  40.66 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1516  hemolysin A  39.85 
 
 		 270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.559805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  40 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  36.52 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  39.72 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  40.22 
 
 		 267 aa  165  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  39.42 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  36.79 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  39.93 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  39.71 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  36.71 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2875  hemolysin A  38.52 
 
 		 248 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  39.78 
 
 		 264 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  38.55 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  39.07 
 
 		 264 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  39.07 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  40.22 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  39.05 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  36.67 
 
 		 264 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  38.24 
 
 		 248 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  38.43 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  38.32 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  40.58 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0443  hemolysin A  38.69 
 
 		 246 aa  159  8e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0606544  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  37.76 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  40.5 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2200  hemolysin A  40.36 
 
 		 268 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  37.36 
 
 		 269 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  42.91 
 
 		 252 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1098  hemolysin A  42.22 
 
 		 246 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0798  putative rRNA methylase  39.13 
 
 		 257 aa  155  9e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  39.48 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1340  hemolysin A  39.66 
 
 		 348 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  42.96 
 
 		 252 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  37.59 
 
 		 274 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6058  hemolysin A  39.43 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  35.36 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  39.26 
 
 		 270 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16431  rRNA methyltransferase  36.81 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  39.26 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  39.03 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  39.42 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  39.27 
 
 		 253 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>