209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0619 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0598  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  99.1 
 
 		 332 aa  666    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0619  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  100 
 
 		 332 aa  671    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.109735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5918  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  76.58 
 
 		 400 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4059  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  80.48 
 
 		 333 aa  498  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4131  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  58.23 
 
 		 332 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0653  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  53.94 
 
 		 273 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0655  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  74.48 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  67.57 
 
 		 263 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0490  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  74 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3287  putative hemolysin  54.86 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0118  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  54.68 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0891926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3486  hemolysin A  40 
 
 		 252 aa  139  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.72701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  42.58 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  42.58 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  65.96 
 
 		 273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  52.41 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  42.58 
 
 		 268 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  43.79 
 
 		 267 aa  127  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1448  hemolysin A  48.61 
 
 		 253 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.948802  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1441  hemolysin A  41.92 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  45.16 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2981  hemolysin A  45.16 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  46.75 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  48.08 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  44.52 
 
 		 267 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  44.52 
 
 		 267 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  50 
 
 		 249 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  41.11 
 
 		 248 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  48.39 
 
 		 252 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2302  hemolysin A  43.68 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  45.86 
 
 		 242 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  46.15 
 
 		 250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  51.72 
 
 		 252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  39.74 
 
 		 270 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  51.03 
 
 		 269 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  42.58 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1098  hemolysin A  46.79 
 
 		 246 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3916  regulatory protein, DeoR  55.67 
 
 		 262 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00126237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2767  hemolysin A  40.88 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000408099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  44.87 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  40.76 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0632  hemolysin A  49.64 
 
 		 251 aa  112  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0985618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0454  hemolysin A  40.22 
 
 		 253 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1226  hemolysin A  46.5 
 
 		 249 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13650  predicted rRNA methylase  43.59 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  47.1 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  44.9 
 
 		 252 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2875  hemolysin A  43.95 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  51.41 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  42.47 
 
 		 248 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  43.23 
 
 		 269 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  41.67 
 
 		 266 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  43.62 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  44.87 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  40.66 
 
 		 260 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  41.67 
 
 		 266 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  38.79 
 
 		 266 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  43.62 
 
 		 264 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  42.31 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  44.38 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  44.52 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  45.81 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  43.4 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0443  hemolysin A  43.06 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0606544  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  40 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1158  hemolysin A  45.45 
 
 		 240 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  44.74 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  46.94 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  46.45 
 
 		 265 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2480  hemolysin A  41.62 
 
 		 279 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127708  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  44.03 
 
 		 318 aa  105  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  45.33 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  44.74 
 
 		 264 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2697  hemolysin A  35.15 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  43.95 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  45.39 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  42.31 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  40.62 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  37.65 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  43.33 
 
 		 271 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  45.16 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  43.97 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  45.1 
 
 		 367 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  42.5 
 
 		 258 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  43.75 
 
 		 270 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  46.94 
 
 		 274 aa  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  39.76 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  45.83 
 
 		 270 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  44.44 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0476  hemolysin A  46.98 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763875  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  44.52 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  40.49 
 
 		 269 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  46.43 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  39.01 
 
 		 246 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  44.87 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  39.26 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1516  hemolysin A  46.21 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.559805  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  44.87 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  40.65 
 
 		 247 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  44.3 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>