211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0184 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  100 
 
 
273 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  60.66 
 
 
285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  57.71 
 
 
263 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3486  hemolysin A  51.21 
 
 
252 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.72701  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0653  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  53.93 
 
 
273 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4131  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  51.27 
 
 
332 aa  248  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3287  putative hemolysin  54.69 
 
 
260 aa  246  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.131488  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0490  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  48.98 
 
 
358 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0118  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  49.4 
 
 
302 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0891926 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1448  hemolysin A  51.43 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.948802  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0655  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  55.65 
 
 
251 aa  217  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  47.15 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6058  hemolysin A  49 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  49.19 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2169  hemolysin A  50 
 
 
268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00065154  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1911  hemolysin A  49.8 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.258384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1902  hemolysin A  48.19 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.485461  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1516  hemolysin A  46.75 
 
 
270 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.559805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  47.79 
 
 
258 aa  195  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  45.16 
 
 
269 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1340  hemolysin A  44.66 
 
 
348 aa  192  7e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  46.06 
 
 
318 aa  191  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  43.95 
 
 
252 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2480  hemolysin A  48.03 
 
 
279 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127708  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1515  hemolysin A  45.75 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000301327 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3916  regulatory protein, DeoR  44.58 
 
 
262 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00126237  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  46.91 
 
 
247 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5441  hemolysin A  45.53 
 
 
268 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  45.12 
 
 
265 aa  188  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  46.34 
 
 
267 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  43.85 
 
 
279 aa  185  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  44.81 
 
 
282 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1751  hemolysin A  41.73 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00952938  hitchhiker  0.000670381 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  44.67 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  44.67 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  44.67 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  44.9 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  44.67 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  44.67 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  46.15 
 
 
272 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  44.76 
 
 
272 aa  183  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  43.8 
 
 
284 aa  183  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  44.67 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  45.08 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  46.53 
 
 
266 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  46.12 
 
 
257 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  44.26 
 
 
279 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2383  hemolysin A  44.35 
 
 
271 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  44.27 
 
 
253 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25470  hemolysin A  46.37 
 
 
276 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  41.94 
 
 
264 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  44.26 
 
 
279 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0679  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  42.8 
 
 
267 aa  180  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  44.26 
 
 
279 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  45.31 
 
 
276 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  41.94 
 
 
264 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  45.71 
 
 
267 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  44.86 
 
 
277 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  43.44 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  46.31 
 
 
367 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  41.63 
 
 
267 aa  179  4e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  41.63 
 
 
267 aa  179  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  44.31 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1657  hemolysin A  47.97 
 
 
286 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0477677  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  43.62 
 
 
271 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  44.31 
 
 
287 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  44.03 
 
 
266 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3027  hemolysin A  44.49 
 
 
266 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  44.03 
 
 
266 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  44.08 
 
 
270 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  45.08 
 
 
268 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  44.31 
 
 
250 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  41.06 
 
 
270 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  43.15 
 
 
271 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5431  hemolysin A  46.77 
 
 
296 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.390939 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  43.85 
 
 
268 aa  176  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3160  hemolysin A  43.18 
 
 
291 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0320918  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2357  hemolysin A  45.75 
 
 
276 aa  175  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347309  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  42.28 
 
 
270 aa  175  6e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  42.68 
 
 
268 aa  175  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  45.31 
 
 
251 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  43.5 
 
 
277 aa  174  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  45.93 
 
 
270 aa  175  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2200  hemolysin A  44.8 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2828  hemolysin A  43.32 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  44.9 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  44.35 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  45.06 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  44.35 
 
 
248 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0798  putative rRNA methylase  44.71 
 
 
257 aa  172  5e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  45.9 
 
 
249 aa  172  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  41.06 
 
 
272 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0401  hemolysin A  41.56 
 
 
250 aa  171  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  40.65 
 
 
270 aa  171  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0476  hemolysin A  45.97 
 
 
281 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763875  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  42 
 
 
265 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  40 
 
 
266 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  40.33 
 
 
269 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  45.12 
 
 
250 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  40.82 
 
 
270 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>