210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4682 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  100 
 
 		 263 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0653  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  65.93 
 
 		 273 aa  328  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0490  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  58 
 
 		 358 aa  326  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4131  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  62.18 
 
 		 332 aa  324  8.000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0655  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  64.98 
 
 		 251 aa  289  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  57.71 
 
 		 273 aa  264  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3287  putative hemolysin  57.03 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0118  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  52.29 
 
 		 302 aa  248  9e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0891926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  56.64 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1448  hemolysin A  50 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.948802  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3486  hemolysin A  45.74 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.72701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4059  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  67.31 
 
 		 333 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3916  regulatory protein, DeoR  47.45 
 
 		 262 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00126237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  47.41 
 
 		 242 aa  195  6e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0619  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  67.57 
 
 		 332 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.109735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0598  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  67.57 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5918  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  66.89 
 
 		 400 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  48.81 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  48.41 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  48.03 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  48.61 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  48.45 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  45.2 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  47.43 
 
 		 257 aa  184  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  43.94 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  46.64 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  47.86 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  40.08 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  47.86 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  45.02 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  45.14 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  44.84 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  45.02 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  42.46 
 
 		 271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  42.46 
 
 		 271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  42.35 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  46.09 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  44.66 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  45.7 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  39.69 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0679  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  39.46 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  39.46 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  45.04 
 
 		 272 aa  175  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  47.81 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  44.62 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  43.87 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  45.7 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  41.54 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2981  hemolysin A  46.61 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  46.43 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  46.85 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  46.22 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  44.44 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  39.69 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  48.4 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  44.84 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  47.22 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2875  hemolysin A  42.35 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  42.06 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  43.14 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  42.06 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  42.06 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  42.06 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  42.06 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  44.02 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  41.27 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  42.06 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6058  hemolysin A  47.45 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  42.97 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  43.65 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  38.61 
 
 		 272 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0443  hemolysin A  39.3 
 
 		 246 aa  169  6e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0606544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  41.54 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  48.82 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  44.09 
 
 		 267 aa  168  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0798  putative rRNA methylase  43.3 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  41.67 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1441  hemolysin A  42.54 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1098  hemolysin A  49 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  42.06 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  43.82 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2302  hemolysin A  43.02 
 
 		 316 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  41.25 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  39.76 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  40.87 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  41.25 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  43.87 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1902  hemolysin A  46.09 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.485461  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  43.85 
 
 		 264 aa  165  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  41.9 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  48.81 
 
 		 252 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  41.9 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  38.34 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  43.48 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  47.47 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2480  hemolysin A  45.88 
 
 		 279 aa  165  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127708  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  42.13 
 
 		 267 aa  165  8e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0992  hemolysin A  41.67 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  43.65 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1047  hemolysin A  41.5 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.940085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>