210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0679 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0679  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  100 
 
 		 267 aa  544  1e-154  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0798  putative rRNA methylase  61.94 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  47.76 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1124  hemolysin A  43.48 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6058  hemolysin A  44.49 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  45.12 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  45.02 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  45.02 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2169  hemolysin A  43.78 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00065154  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  43.48 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  43.82 
 
 		 247 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  43.72 
 
 		 257 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  42.17 
 
 		 268 aa  185  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1515  hemolysin A  41.7 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000301327 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  40.73 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  42.46 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  40.49 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  40.49 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2966  hemolysin A  40.49 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.173623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2383  hemolysin A  39.76 
 
 		 271 aa  182  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  42.86 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  42.51 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  43.5 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  43.08 
 
 		 248 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  40.96 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1516  hemolysin A  41.87 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.559805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  41.57 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  42.8 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  43.15 
 
 		 367 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2828  hemolysin A  40 
 
 		 275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  42.34 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0401  hemolysin A  41.83 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3290  hemolysin A  40.96 
 
 		 269 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2357  hemolysin A  39.2 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347309  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  40.16 
 
 		 267 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1657  hemolysin A  40.16 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0477677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  39.46 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  47.58 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1902  hemolysin A  38.55 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.485461  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  43.25 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3916  regulatory protein, DeoR  40.31 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00126237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1098  hemolysin A  46.37 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1911  hemolysin A  39.36 
 
 		 281 aa  175  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.258384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2155  hemolysin A  38.58 
 
 		 247 aa  175  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482655  hitchhiker  0.00924028 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25470  hemolysin A  40.96 
 
 		 276 aa  175  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  40.16 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  42.97 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  41.53 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1340  hemolysin A  39.02 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  40.56 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3160  hemolysin A  40.08 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0320918  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3027  hemolysin A  40.73 
 
 		 266 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  40.78 
 
 		 269 aa  171  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4074  hemolysin A  40.16 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198624  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  39.11 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  41.8 
 
 		 270 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  40.65 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  39.27 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  42.29 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1226  hemolysin A  46.37 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  41.06 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  38.87 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  42.45 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  40.74 
 
 		 240 aa  168  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  40.62 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  38.2 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  40.7 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1751  hemolysin A  37.86 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00952938  hitchhiker  0.000670381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  39.92 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  42.8 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  41.13 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  41.77 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  43.95 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1158  hemolysin A  46.69 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5431  hemolysin A  42.4 
 
 		 296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.390939 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  40.89 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14230  hemolysin A  40.16 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  38.65 
 
 		 285 aa  165  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  38.31 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5441  hemolysin A  38.46 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2480  hemolysin A  40.08 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127708  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  41.7 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  40 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  40.64 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  38.49 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  41.37 
 
 		 250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  36.43 
 
 		 246 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  39.92 
 
 		 252 aa  161  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  37.3 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  40.32 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  40.39 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  40.65 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2981  hemolysin A  42.4 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  40.65 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  38.8 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  39.29 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  41.37 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  40.96 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  39.84 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13650  predicted rRNA methylase  38.06 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>