215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3012 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  100 
 
 
265 aa  511  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  66.3 
 
 
269 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  66.3 
 
 
269 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4074  hemolysin A  67.28 
 
 
272 aa  329  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198624  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2966  hemolysin A  66.3 
 
 
269 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.173623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  66.42 
 
 
268 aa  326  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5441  hemolysin A  70.85 
 
 
268 aa  325  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3290  hemolysin A  64.44 
 
 
269 aa  317  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  66.54 
 
 
266 aa  315  6e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25470  hemolysin A  66.79 
 
 
276 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  64.68 
 
 
268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2383  hemolysin A  63.47 
 
 
271 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2828  hemolysin A  61.96 
 
 
275 aa  309  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3027  hemolysin A  63.77 
 
 
266 aa  309  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  64.66 
 
 
269 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1902  hemolysin A  65.41 
 
 
281 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.485461  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4439  hemolysin A  65.78 
 
 
272 aa  302  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.104243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6058  hemolysin A  62.13 
 
 
272 aa  301  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5431  hemolysin A  67.54 
 
 
296 aa  297  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.390939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  66.29 
 
 
270 aa  295  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2169  hemolysin A  65.79 
 
 
268 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00065154  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1911  hemolysin A  68.53 
 
 
281 aa  294  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.258384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3160  hemolysin A  61.73 
 
 
291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0320918  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1751  hemolysin A  59.36 
 
 
329 aa  279  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00952938  hitchhiker  0.000670381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2480  hemolysin A  65.86 
 
 
279 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127708  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  58.66 
 
 
267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1516  hemolysin A  57.61 
 
 
270 aa  245  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.559805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1515  hemolysin A  55.79 
 
 
271 aa  240  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000301327 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  55.77 
 
 
318 aa  236  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2357  hemolysin A  58.37 
 
 
276 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347309  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  49.22 
 
 
269 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2200  hemolysin A  53.6 
 
 
268 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  46.44 
 
 
264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  46.44 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1657  hemolysin A  58.09 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0477677  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  47.2 
 
 
271 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  47.37 
 
 
266 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  47.37 
 
 
266 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0476  hemolysin A  49.44 
 
 
281 aa  216  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763875  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  49.6 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  47.39 
 
 
270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  47.13 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  49.8 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14230  hemolysin A  58.3 
 
 
280 aa  212  5.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  51.33 
 
 
265 aa  211  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1340  hemolysin A  54.58 
 
 
348 aa  210  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  53.53 
 
 
287 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  41.67 
 
 
267 aa  209  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  41.67 
 
 
267 aa  209  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  49.79 
 
 
277 aa  209  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  41.15 
 
 
266 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  42.53 
 
 
284 aa  208  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  49.05 
 
 
264 aa  205  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  50.41 
 
 
282 aa  205  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  40.73 
 
 
270 aa  205  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  44.44 
 
 
272 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1124  hemolysin A  48.99 
 
 
310 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  52.08 
 
 
264 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  47.62 
 
 
267 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  46.34 
 
 
270 aa  202  6e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1557  hemolysin A  39.48 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16541  rRNA methyltransferase  39.48 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.435905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  50.8 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  48.16 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  39.59 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  48.35 
 
 
271 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13650  predicted rRNA methylase  53.75 
 
 
281 aa  199  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  44.18 
 
 
250 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  39.18 
 
 
271 aa  198  7e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  39.18 
 
 
271 aa  198  7e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  48.61 
 
 
367 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16431  rRNA methyltransferase  41.11 
 
 
270 aa  198  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  43.44 
 
 
269 aa  198  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  45.75 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16661  rRNA methyltransferase  39.6 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  39.46 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  42.21 
 
 
276 aa  195  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  45.08 
 
 
274 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  49.58 
 
 
252 aa  193  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  40.89 
 
 
270 aa  193  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  38.27 
 
 
264 aa  192  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  46.91 
 
 
247 aa  192  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  43.98 
 
 
282 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  44.44 
 
 
267 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  41.3 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  38.85 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  45 
 
 
276 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  47.43 
 
 
272 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  42.8 
 
 
269 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  45.12 
 
 
273 aa  188  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  47.56 
 
 
246 aa  188  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  46.89 
 
 
240 aa  188  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  40.94 
 
 
277 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  47.35 
 
 
249 aa  185  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  43.32 
 
 
268 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  46.94 
 
 
251 aa  185  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  45.27 
 
 
257 aa  185  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  45.27 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  46.24 
 
 
267 aa  181  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  44.4 
 
 
252 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>