211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4307 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  100 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1020  hemolysin A  85.37 
 
 		 246 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4461  hemolysin A  89.84 
 
 		 246 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  77.92 
 
 		 245 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  79.17 
 
 		 246 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0777  hemolysin A  82.45 
 
 		 251 aa  363  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.850156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0632  hemolysin A  77.96 
 
 		 251 aa  343  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0985618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  53.5 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  57.92 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  47.98 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  51.67 
 
 		 250 aa  215  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  52.08 
 
 		 250 aa  215  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2155  hemolysin A  51.03 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482655  hitchhiker  0.00924028 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  49.59 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  52.92 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  44.44 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  49.79 
 
 		 252 aa  204  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  50.2 
 
 		 264 aa  204  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  47.2 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  47.26 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3820  hemolysin A  51.48 
 
 		 263 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2377  hemolysin A  54.58 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  47.93 
 
 		 247 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  42.13 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  46.84 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  47.03 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  43.39 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4163  hemolysin A  51.59 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  42.45 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  45 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  45.26 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  45.49 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  46.64 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  47.08 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  45.8 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  45.8 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  44.96 
 
 		 279 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  45.15 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0852  hemolysin A  49.37 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349901  normal  0.605509 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  42.68 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  42.68 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  45.42 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  45.42 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  45.42 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  45.42 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  43.33 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  45.42 
 
 		 279 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  45.42 
 
 		 279 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  45.87 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  45 
 
 		 279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  43.98 
 
 		 277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  44.58 
 
 		 279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  44.17 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  46.41 
 
 		 367 aa  178  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  40.68 
 
 		 264 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  43.55 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  43.93 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  46.91 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  45.04 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  44.73 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  44.35 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  40.33 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  46.22 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  39.75 
 
 		 271 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  39.75 
 
 		 271 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2875  hemolysin A  44.21 
 
 		 248 aa  174  8e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  45.38 
 
 		 260 aa  175  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  43.15 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  45.45 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  41.3 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  39.83 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  38.59 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  40.66 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  45.67 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  41.74 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  44.81 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  38.56 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  42.06 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  45.64 
 
 		 267 aa  168  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0992  hemolysin A  42 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  43.15 
 
 		 242 aa  168  7e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  45.8 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  40.66 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0443  hemolysin A  38.91 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0606544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  40.83 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  43.03 
 
 		 274 aa  165  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  43.95 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0798  putative rRNA methylase  41.83 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0653  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  40.96 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  43.8 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0702  hemolysin A  37.6 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  41.67 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  41.96 
 
 		 263 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  40.83 
 
 		 288 aa  162  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0679  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  36.43 
 
 		 267 aa  161  7e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  39.34 
 
 		 275 aa  161  8.000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  42.44 
 
 		 282 aa  161  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0688  hemolysin A  38.7 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000097723  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  42.45 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2302  hemolysin A  40.8 
 
 		 316 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>