210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3160 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3160  hemolysin A  100 
 
 
291 aa  557  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0320918  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1751  hemolysin A  72.66 
 
 
329 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00952938  hitchhiker  0.000670381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  62.94 
 
 
266 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6058  hemolysin A  61.94 
 
 
272 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5431  hemolysin A  64.83 
 
 
296 aa  305  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.390939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2169  hemolysin A  63.96 
 
 
268 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00065154  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1902  hemolysin A  61.4 
 
 
281 aa  299  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.485461  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  62.72 
 
 
269 aa  298  7e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3027  hemolysin A  59.79 
 
 
266 aa  296  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3290  hemolysin A  60.14 
 
 
269 aa  292  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  60.63 
 
 
265 aa  289  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2828  hemolysin A  61.74 
 
 
275 aa  287  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  57.5 
 
 
268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4074  hemolysin A  58.76 
 
 
272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198624  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  61.48 
 
 
270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  57.24 
 
 
268 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  60.15 
 
 
269 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  60.15 
 
 
269 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2966  hemolysin A  60.15 
 
 
269 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.173623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1911  hemolysin A  60.42 
 
 
281 aa  278  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.258384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5441  hemolysin A  57.99 
 
 
268 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25470  hemolysin A  62.5 
 
 
276 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2383  hemolysin A  56.21 
 
 
271 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2480  hemolysin A  60.14 
 
 
279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127708  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  55.94 
 
 
267 aa  259  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2357  hemolysin A  55.97 
 
 
276 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347309  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1657  hemolysin A  58.65 
 
 
286 aa  241  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0477677  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  54.92 
 
 
318 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4439  hemolysin A  55.8 
 
 
272 aa  235  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.104243 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1515  hemolysin A  50.97 
 
 
271 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000301327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1516  hemolysin A  50.58 
 
 
270 aa  218  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.559805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  46.24 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  47.13 
 
 
271 aa  212  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  41.76 
 
 
270 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  49.45 
 
 
264 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  43.13 
 
 
266 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  39.35 
 
 
271 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  39.35 
 
 
271 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  44.65 
 
 
264 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  44.65 
 
 
264 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1340  hemolysin A  53.61 
 
 
348 aa  205  7e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  40.36 
 
 
267 aa  204  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  40.36 
 
 
267 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  44.93 
 
 
274 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  42.91 
 
 
284 aa  203  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  46.67 
 
 
267 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  45.69 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  45.04 
 
 
242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  46.79 
 
 
272 aa  198  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  40.91 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  46.77 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2200  hemolysin A  45.36 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  47.46 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  46.04 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  43.43 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0476  hemolysin A  45.07 
 
 
281 aa  196  6e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  42.53 
 
 
266 aa  195  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  46.42 
 
 
276 aa  195  7e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  39.16 
 
 
269 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  46.24 
 
 
272 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  45.98 
 
 
250 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  45.08 
 
 
266 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  45.79 
 
 
270 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  45.08 
 
 
266 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0798  putative rRNA methylase  48.65 
 
 
257 aa  192  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  47.35 
 
 
265 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16431  rRNA methyltransferase  39.71 
 
 
270 aa  191  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  41.64 
 
 
270 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16661  rRNA methyltransferase  36.43 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  45.17 
 
 
267 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  46.74 
 
 
257 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  44.4 
 
 
277 aa  188  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  46.36 
 
 
257 aa  188  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16541  rRNA methyltransferase  38.24 
 
 
270 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.435905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  46.27 
 
 
367 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  42.65 
 
 
272 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  43.02 
 
 
269 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  48.46 
 
 
264 aa  185  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1226  hemolysin A  51.89 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  44.79 
 
 
287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1557  hemolysin A  35.74 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  42.37 
 
 
269 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  42.42 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  46.18 
 
 
252 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  40.22 
 
 
276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  36.64 
 
 
264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  44.17 
 
 
267 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  42.44 
 
 
267 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  39.7 
 
 
272 aa  178  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  41.98 
 
 
247 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  46.59 
 
 
249 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  50.76 
 
 
252 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1098  hemolysin A  50.57 
 
 
246 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  38.79 
 
 
277 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  44.06 
 
 
251 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  39.54 
 
 
279 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  39.54 
 
 
279 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  43.18 
 
 
273 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  45 
 
 
246 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  39.39 
 
 
279 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>