212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4311 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  100 
 
 		 250 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  98.4 
 
 		 250 aa  474  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  93.95 
 
 		 249 aa  424  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  67.34 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2377  hemolysin A  68.85 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3820  hemolysin A  67.09 
 
 		 263 aa  268  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  61.76 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  52.48 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4163  hemolysin A  60.74 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0852  hemolysin A  54.58 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349901  normal  0.605509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  52.05 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  52.5 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  44.58 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  50.81 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  56.25 
 
 		 264 aa  221  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  56.15 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  48.99 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  49.17 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0632  hemolysin A  55.83 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0985618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  53.69 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2155  hemolysin A  50 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482655  hitchhiker  0.00924028 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  52.08 
 
 		 246 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  50 
 
 		 257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  50.21 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  53.72 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1020  hemolysin A  52.5 
 
 		 246 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  49.8 
 
 		 268 aa  214  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  47.35 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0777  hemolysin A  52.92 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.850156  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  51.43 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  52.67 
 
 		 276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  51 
 
 		 267 aa  211  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  50 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  52.1 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  50.2 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  51.5 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  52.32 
 
 		 367 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  53.31 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  45.71 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  45.31 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  45.71 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  45.71 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  45.71 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  45.71 
 
 		 279 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  45.71 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  45.71 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  50.61 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  45.31 
 
 		 279 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  45.31 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4461  hemolysin A  52.92 
 
 		 246 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  50 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  44.72 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  44.09 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  50.63 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  46.4 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  50.61 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  50 
 
 		 253 aa  201  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  51.87 
 
 		 271 aa  201  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  45.64 
 
 		 269 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  48.16 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  45.1 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  44.86 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  47.56 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  45.64 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  48.96 
 
 		 248 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  50.62 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  44.08 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  51.67 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  43.21 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  43.21 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  43.4 
 
 		 271 aa  195  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  42.04 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  42.04 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  45.38 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  44.44 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  54.27 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  46.56 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6058  hemolysin A  49.59 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  42.45 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  42.45 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  41.84 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0992  hemolysin A  46.15 
 
 		 263 aa  191  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  47.7 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  40.16 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  41.8 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  47.3 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  44.4 
 
 		 277 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  42.86 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  51.26 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0604  hemolysin A  50.21 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30581  normal  0.619961 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  43.72 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  49.17 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  44.35 
 
 		 270 aa  184  9e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  45.68 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  42.68 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  47.33 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  42.37 
 
 		 248 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2357  hemolysin A  48.76 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347309  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0702  hemolysin A  40.5 
 
 		 243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  47.86 
 
 		 263 aa  181  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>