210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1601 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  100 
 
 
278 aa  567  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  70.33 
 
 
273 aa  384  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  63.3 
 
 
268 aa  334  9e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  58.33 
 
 
288 aa  326  3e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  57.61 
 
 
279 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  58.55 
 
 
275 aa  317  1e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  60.16 
 
 
277 aa  316  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  56.88 
 
 
279 aa  315  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  57.25 
 
 
279 aa  315  8e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  56.52 
 
 
279 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  56.52 
 
 
279 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  56.52 
 
 
279 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  56.52 
 
 
279 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  56.52 
 
 
279 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  56.88 
 
 
279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  57.25 
 
 
279 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  56.16 
 
 
279 aa  311  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  61.98 
 
 
282 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  60.08 
 
 
270 aa  295  4e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  50.37 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  50.37 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  50.37 
 
 
271 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  50.4 
 
 
268 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  49.06 
 
 
270 aa  258  8e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  46.89 
 
 
270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  51.59 
 
 
276 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  48.4 
 
 
279 aa  250  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  47.45 
 
 
266 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  47.6 
 
 
272 aa  249  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  46.44 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  45.9 
 
 
274 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  50.4 
 
 
269 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  48.59 
 
 
269 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  47.97 
 
 
269 aa  235  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  47.66 
 
 
267 aa  231  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  47.97 
 
 
252 aa  231  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  48.4 
 
 
276 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  44.79 
 
 
367 aa  229  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  48.19 
 
 
250 aa  228  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  47.76 
 
 
257 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  47.18 
 
 
257 aa  221  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  46.5 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  46.25 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  46.56 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  44.28 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  44.28 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  45.78 
 
 
252 aa  214  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  44.83 
 
 
240 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  47.39 
 
 
272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  44.87 
 
 
264 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  48.58 
 
 
267 aa  209  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  47.08 
 
 
264 aa  208  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  45.35 
 
 
266 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  49.09 
 
 
227 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  48.32 
 
 
260 aa  206  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  45 
 
 
251 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  44.98 
 
 
246 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  44.79 
 
 
266 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0702  hemolysin A  45.97 
 
 
243 aa  204  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0472  hemolysin A  45.64 
 
 
268 aa  204  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.517404  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  42.86 
 
 
270 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  45.53 
 
 
249 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  44.09 
 
 
250 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  42.11 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  42.08 
 
 
284 aa  198  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  42.04 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  42.17 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  45.31 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  45.75 
 
 
242 aa  196  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  43.32 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  44.81 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  44.84 
 
 
250 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl329  rRNA methylase  41.95 
 
 
267 aa  194  1e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142948  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  43.44 
 
 
270 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  44.36 
 
 
249 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  41.26 
 
 
267 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  41.18 
 
 
271 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  43.32 
 
 
245 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  42.04 
 
 
267 aa  190  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  38.99 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  42.54 
 
 
267 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  44.13 
 
 
272 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  43.9 
 
 
270 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  42.91 
 
 
277 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2200  hemolysin A  40.87 
 
 
268 aa  186  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  39.92 
 
 
264 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  39.92 
 
 
264 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12600  predicted protein  45.5 
 
 
245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.78844 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2767  hemolysin A  45.57 
 
 
240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000408099  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0476  hemolysin A  40.74 
 
 
281 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763875  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  39.02 
 
 
272 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  40.65 
 
 
248 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1902  hemolysin A  40.77 
 
 
281 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.485461  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  39.84 
 
 
287 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2383  hemolysin A  36.5 
 
 
271 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1557  hemolysin A  38.64 
 
 
270 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2981  hemolysin A  42.51 
 
 
249 aa  178  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16661  rRNA methyltransferase  38.26 
 
 
270 aa  178  7e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16541  rRNA methyltransferase  38.17 
 
 
270 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.435905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  36.58 
 
 
265 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>