220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0992 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0992  hemolysin A  100 
 
 		 263 aa  531  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  77.69 
 
 		 251 aa  381  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  73.66 
 
 		 248 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0604  hemolysin A  75.72 
 
 		 248 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30581  normal  0.619961 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  63.79 
 
 		 253 aa  308  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  61.41 
 
 		 253 aa  297  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  64.32 
 
 		 252 aa  296  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  61.83 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0401  hemolysin A  54.47 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  50.62 
 
 		 247 aa  228  8e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  48.55 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  47.54 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  44.49 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2155  hemolysin A  46.06 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482655  hitchhiker  0.00924028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  45.02 
 
 		 267 aa  195  5.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  46.15 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  45.34 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  46.72 
 
 		 249 aa  188  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  41.37 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3820  hemolysin A  47.18 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  43.03 
 
 		 264 aa  185  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  44.17 
 
 		 242 aa  184  9e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  41.8 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4163  hemolysin A  49.79 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  42.86 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  41.43 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  42.5 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1516  hemolysin A  45.19 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.559805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  44.76 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1515  hemolysin A  45.02 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000301327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  43.15 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  41.67 
 
 		 267 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  41.67 
 
 		 267 aa  178  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14230  hemolysin A  43.25 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1047  hemolysin A  43.67 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.940085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0777  hemolysin A  43.7 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.850156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  44.94 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  39.44 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  40.08 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  40.49 
 
 		 269 aa  175  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2377  hemolysin A  46 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  37.65 
 
 		 266 aa  174  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0852  hemolysin A  44.81 
 
 		 244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349901  normal  0.605509 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13650  predicted rRNA methylase  42.68 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  41.74 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  41.74 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  40.56 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  45.71 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0798  putative rRNA methylase  40.93 
 
 		 257 aa  171  7.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  44.17 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  43.03 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0632  hemolysin A  45.45 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0985618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  41.32 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3486  hemolysin A  41.3 
 
 		 252 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.72701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2169  hemolysin A  42.74 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00065154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  42.02 
 
 		 273 aa  168  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  42 
 
 		 246 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  42.08 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  41.98 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  42.86 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2828  hemolysin A  41.08 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1098  hemolysin A  43.95 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  39.75 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  41.18 
 
 		 367 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  40.16 
 
 		 272 aa  165  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  39.76 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  41.39 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  42.26 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  41.67 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3916  regulatory protein, DeoR  42.11 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00126237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  38.04 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  41.84 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  40.41 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4461  hemolysin A  42.4 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  40.6 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  43.21 
 
 		 272 aa  161  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2357  hemolysin A  42.13 
 
 		 276 aa  161  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347309  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  39.53 
 
 		 282 aa  160  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  39.51 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  38.43 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0454  hemolysin A  37.6 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  38.43 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  43.8 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  40.59 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  39.68 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1441  hemolysin A  37.12 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  39.22 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  40.76 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  39.36 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  39.44 
 
 		 266 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1124  hemolysin A  41.98 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  39.58 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1340  hemolysin A  44.09 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  39.84 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1020  hemolysin A  39.84 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  38.65 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  39.68 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  42.58 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  38.02 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  39.68 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>