211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0718 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  100 
 
 
255 aa  501  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  63.03 
 
 
256 aa  298  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  61.76 
 
 
250 aa  271  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  60.5 
 
 
250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  64.29 
 
 
250 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  61.76 
 
 
249 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2377  hemolysin A  67.23 
 
 
250 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  54.17 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  53.75 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3820  hemolysin A  61.6 
 
 
263 aa  241  9e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  53.78 
 
 
245 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  53.5 
 
 
246 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4163  hemolysin A  58.57 
 
 
266 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  57.08 
 
 
247 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1020  hemolysin A  51.63 
 
 
246 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0632  hemolysin A  56.3 
 
 
251 aa  228  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0985618  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  52.21 
 
 
251 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  53.56 
 
 
264 aa  221  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0777  hemolysin A  54.2 
 
 
251 aa  221  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.850156  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  52.07 
 
 
246 aa  218  7.999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  49.79 
 
 
248 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  49 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  46.5 
 
 
266 aa  214  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  51.06 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  48.41 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4461  hemolysin A  51.37 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  49.79 
 
 
252 aa  208  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  48.96 
 
 
252 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2155  hemolysin A  49.79 
 
 
247 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482655  hitchhiker  0.00924028 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0992  hemolysin A  47.93 
 
 
263 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  49.15 
 
 
279 aa  206  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0604  hemolysin A  50.21 
 
 
248 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30581  normal  0.619961 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  46.67 
 
 
269 aa  204  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0852  hemolysin A  51.05 
 
 
244 aa  203  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349901  normal  0.605509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  52.34 
 
 
264 aa  202  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  47.44 
 
 
277 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  47.52 
 
 
276 aa  201  8e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  47.74 
 
 
251 aa  201  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  48.35 
 
 
249 aa  201  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  47.9 
 
 
270 aa  201  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  48.95 
 
 
246 aa  201  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  48.41 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  48.12 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  47.7 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  51.03 
 
 
267 aa  198  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  48.54 
 
 
367 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  51.02 
 
 
272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  46.89 
 
 
257 aa  195  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  47.68 
 
 
250 aa  194  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  46.64 
 
 
252 aa  193  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  46.55 
 
 
240 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  41.91 
 
 
267 aa  192  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  41.91 
 
 
267 aa  192  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  47.74 
 
 
267 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  45 
 
 
279 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  45 
 
 
279 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  45 
 
 
279 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  45.42 
 
 
279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  45.42 
 
 
279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  45.42 
 
 
279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  45.42 
 
 
279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  45.42 
 
 
279 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  46.84 
 
 
257 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0798  putative rRNA methylase  46.89 
 
 
257 aa  188  9e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  45 
 
 
279 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  41.53 
 
 
268 aa  187  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  45 
 
 
279 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  43.51 
 
 
266 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  40.95 
 
 
271 aa  186  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  42.86 
 
 
270 aa  185  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  44.35 
 
 
267 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0679  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  40.96 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  42.11 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  42.11 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  42.62 
 
 
264 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  45.19 
 
 
268 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  42.8 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  47.26 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  44.17 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  42.62 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  46.46 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3290  hemolysin A  46.44 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  47.23 
 
 
271 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  44.54 
 
 
269 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  43.15 
 
 
278 aa  181  8.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  43.51 
 
 
269 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  44.58 
 
 
268 aa  181  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  44.21 
 
 
277 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  43.21 
 
 
273 aa  180  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  45.12 
 
 
258 aa  178  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  45.06 
 
 
273 aa  178  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0702  hemolysin A  41.74 
 
 
243 aa  177  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  43.39 
 
 
282 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  43.39 
 
 
266 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  43.39 
 
 
266 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2875  hemolysin A  42.45 
 
 
248 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  45.49 
 
 
260 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  45.61 
 
 
269 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  45.61 
 
 
269 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2966  hemolysin A  45.61 
 
 
269 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.173623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>