215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0674 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0674  ribosomal RNA large subunit methyltransferase, FtsJ family  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0691  hemolysin A  65.22 
 
 		 253 aa  309  2e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0616  hemolysin A  64.82 
 
 		 253 aa  308  4e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.516871  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1081  hemolysin A  62.45 
 
 		 253 aa  299  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1016  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  52.02 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  52.92 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0750065  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1370  hemolysin A  48.13 
 
 		 238 aa  218  7.999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1564  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  49.59 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00909837  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2024  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  48.15 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0155981  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1343  hemolysin A  48.02 
 
 		 236 aa  189  5e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.070329  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0443  hemolysin A  38.49 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0606544  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  36.21 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  36.21 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  35.74 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  45.11 
 
 		 268 aa  138  7.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  32.78 
 
 		 268 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  36.21 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3290  hemolysin A  33.06 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  36.21 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0688  hemolysin A  40.09 
 
 		 263 aa  136  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000097723  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  37.82 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  32.23 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  32.23 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2966  hemolysin A  32.23 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.173623 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  33.05 
 
 		 272 aa  135  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  34.69 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  36.65 
 
 		 273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2302  hemolysin A  34.8 
 
 		 316 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1441  hemolysin A  37.89 
 
 		 276 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  32.22 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  34.15 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  31.56 
 
 		 267 aa  129  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  32.23 
 
 		 279 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  30.71 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  33.19 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  35.46 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  32.31 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1020  hemolysin A  35.12 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  33.2 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1138  hemolysin A  30.86 
 
 		 249 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.768192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4439  hemolysin A  33.61 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.104243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0653  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  33.21 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14230  hemolysin A  30.99 
 
 		 280 aa  126  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0852  hemolysin A  38.17 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349901  normal  0.605509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  33.05 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  35.1 
 
 		 277 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4163  hemolysin A  38.25 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  33.87 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2981  hemolysin A  38.1 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1657  hemolysin A  31.65 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0477677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  31.8 
 
 		 265 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  32.91 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  33.47 
 
 		 270 aa  125  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2383  hemolysin A  32.1 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6058  hemolysin A  32.79 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  33.33 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  33.88 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  36.59 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1902  hemolysin A  33.06 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.485461  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  35.57 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1124  hemolysin A  33.06 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3027  hemolysin A  32.91 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  33 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4461  hemolysin A  34.44 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1911  hemolysin A  33.06 
 
 		 281 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.258384 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  37.35 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  33.48 
 
 		 272 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  33.88 
 
 		 270 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  35.68 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  31.08 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  32.92 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4074  hemolysin A  31.22 
 
 		 272 aa  121  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198624  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  30.49 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  32.66 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  31.98 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  37.95 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0454  hemolysin A  36.51 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  33.06 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0702  hemolysin A  36.52 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2200  hemolysin A  36.76 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  31.71 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2828  hemolysin A  31.51 
 
 		 275 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  38.38 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  32.34 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  33.06 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2357  hemolysin A  31.6 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347309  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  38.38 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5441  hemolysin A  30.89 
 
 		 268 aa  118  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  30.92 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  35.14 
 
 		 264 aa  118  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  32.22 
 
 		 367 aa  118  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0777  hemolysin A  33.06 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.850156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  34.35 
 
 		 284 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  37.23 
 
 		 276 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1515  hemolysin A  31.5 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000301327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  34.41 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf183  predicted 23S rRNA methylase  38.5 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.766257  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  29.72 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  32.34 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  31.12 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>