More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0564 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0564  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333277  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  42.63 
 
 		 271 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  42.57 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  40.8 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  40.74 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  40.16 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  39.13 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  39.92 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  37.25 
 
 		 250 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  41.06 
 
 		 608 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  40.87 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4485  ABC transporter related  40.42 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.92 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  41.49 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  39.27 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  37.9 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  38.71 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  39.2 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  38.31 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  39.92 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  38.87 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  36.84 
 
 		 251 aa  165  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  42.5 
 
 		 827 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  36.71 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  35.46 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  37.5 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  35.63 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  42.24 
 
 		 822 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  38.87 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  39.18 
 
 		 590 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  42.44 
 
 		 245 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  39.59 
 
 		 589 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  37.5 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  40.56 
 
 		 589 aa  161  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  36.44 
 
 		 256 aa  161  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  42.08 
 
 		 823 aa  161  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  36.1 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  36.36 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  39.37 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  42.08 
 
 		 823 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7594  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.34 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  36.4 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  40.56 
 
 		 583 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  34.82 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  36.78 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  38.21 
 
 		 595 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  36.95 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  37.2 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  38.06 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3488  ABC transporter related protein  37.77 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  39.17 
 
 		 250 aa  159  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2737  ABC transporter related  36.9 
 
 		 268 aa  158  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  36.33 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  36.33 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  37.96 
 
 		 589 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  38.75 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  37.25 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  38.34 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  38.71 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  36.33 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3819  ABC transporter related  36.8 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0171499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1731  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.385774  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  37.75 
 
 		 590 aa  156  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4426  ABC transporter related  36.76 
 
 		 265 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  36.4 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.96 
 
 		 596 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4016  ABC transporter related  37.04 
 
 		 272 aa  156  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  37.8 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  36.29 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2792  ABC transporter related protein  39.17 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  37.65 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  40.08 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  36.61 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  36.67 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1620  ABC transporter related  38.55 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  37.75 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0231  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.1 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  35.6 
 
 		 294 aa  154  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  40.51 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  36.29 
 
 		 599 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  37.5 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.29 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5665  ABC transporter related  37.65 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  36.65 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  38.37 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  39.44 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  39.24 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  37.9 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2916  ABC transporter related  38.82 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  35.74 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  35.46 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  36.84 
 
 		 598 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  38.71 
 
 		 604 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  38.34 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  35.22 
 
 		 261 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4380  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.794104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  39.92 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  36.84 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>