More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2804 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2804  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 263 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  37.25 
 
 		 261 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  37.55 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  37.55 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  40.73 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  40.48 
 
 		 296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  38.15 
 
 		 277 aa  181  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  38.34 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  37.45 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.92 
 
 		 258 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  38.25 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  39.92 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  37.89 
 
 		 260 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  39.53 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  39.53 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  39.53 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  37.3 
 
 		 262 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.94 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  38.91 
 
 		 261 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  38.4 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  38.34 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  36.14 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.94 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4056  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.71 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  39.13 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  38 
 
 		 257 aa  174  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  37.2 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3869  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.31 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  36.55 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  39.04 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  37.3 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  37.2 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  39.52 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  35.6 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  35.34 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  35.94 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  33.73 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  38.74 
 
 		 265 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  34.94 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  37.85 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  37.11 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  39.84 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  38.55 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  38.28 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0231  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.69 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  38.74 
 
 		 258 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  38.08 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0101  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.95 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  34.27 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  38.25 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  37.15 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  37.98 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  38.91 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  37.1 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  36.55 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  36.25 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  41.44 
 
 		 630 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  37.1 
 
 		 259 aa  168  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  37.65 
 
 		 292 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.41 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1783  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  40.23 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0473168  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  36.55 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  38.31 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  38.31 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  36.22 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  38.33 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  37.85 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  38.31 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  38.28 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  38.31 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  34.38 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  34.8 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  35.2 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  34.8 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  39.29 
 
 		 612 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  40.39 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  33.33 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  36.19 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  35.34 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  33.33 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  36.19 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.08 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  35.04 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  41.83 
 
 		 583 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0260  ABC transporter related protein  35.48 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4772  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  35.34 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  35.89 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0261  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3737  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  35.16 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  36.29 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>