More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4351 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4351  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 303 aa  621  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.44972  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_003296  RS05478  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  34.46 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3314  extracellular solute-binding protein family 3  35.58 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3315  extracellular solute-binding protein family 3  32.59 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2540  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3638  extracellular solute-binding protein family 3  34.21 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4420  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.69 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0608  extracellular solute-binding protein  32.99 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0587  extracellular solute-binding protein family 3  32.65 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2361  extracellular solute-binding protein  32.6 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6147  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 289 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3983  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 311 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0897  extracellular solute-binding protein family 3  30.82 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.529927  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5607  extracellular solute-binding protein  36.58 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5971  extracellular solute-binding protein  36.58 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480702  normal  0.0122202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  30.66 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6471  extracellular solute-binding protein  36.58 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264761  normal  0.0842287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0826  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 		 302 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1123  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 303 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00011354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4578  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 		 296 aa  158  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.575632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  30.48 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  30.85 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67130  putative binding protein component of ABC transporter  31.71 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1172  extracellular solute-binding protein family 3  33.2 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5821  putative ABC transporter binding protein subunit  32.06 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5946  extracellular solute-binding protein  34.87 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4583  glutamate/aspartate ABC transporter periplasmic solute-binding protein  31.75 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.8955  decreased coverage  0.00199709 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  30.14 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  30.14 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1127  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.164793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  30.14 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4074  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4612  extracellular solute-binding protein family 3  29.59 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527898  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  30.14 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6249  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  32.4 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0973  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.78 
 
 		 303 aa  152  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00938185  normal  0.751269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  29.89 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  31.34 
 
 		 302 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  29.96 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  31.34 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  29.96 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  29.96 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  29.96 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  30.61 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4738  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.31 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 		 295 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.45 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.784297 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  29.59 
 
 		 302 aa  149  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0084  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.08 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.767728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1835  glutamate and aspartate transporter subunit  29.1 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2920  glutamate and aspartate transporter subunit  29.1 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.847133  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1655  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  31.34 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.92194  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  28.37 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  29.59 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5904  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3010  glutamate and aspartate transporter subunit  29.1 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197195  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  29.59 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2173  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0070  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  28.72 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2247  extracellular solute-binding protein  34.94 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5289  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  29.52 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  28.81 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  29.59 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  30.48 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  29.59 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5423  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07320  amino acid ABC transporter, perplasmic binding protein  32.22 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  29.59 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2190  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0938958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  28.47 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  28.47 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  28.47 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  28.47 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  29.52 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.26 
 
 		 313 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  29.25 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>