More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6147 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6147  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 298 aa  609  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1072  extracellular solute-binding protein  60.66 
 
 		 295 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4738  extracellular solute-binding protein  49.66 
 
 		 299 aa  297  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4612  extracellular solute-binding protein family 3  52.43 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2087  extracellular solute-binding protein  45.88 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  45.39 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  45.39 
 
 		 306 aa  254  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  44.41 
 
 		 302 aa  254  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  44.88 
 
 		 297 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4543  extracellular solute-binding protein  46.42 
 
 		 301 aa  252  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.517654  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  44.72 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  44.88 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  44.52 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  44.72 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  44.72 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  44.72 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2255  extracellular solute-binding protein  45.32 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  45.32 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4477  extracellular solute-binding protein family 3  44.67 
 
 		 301 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  44.17 
 
 		 297 aa  248  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  43.82 
 
 		 297 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  43.82 
 
 		 297 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3961  extracellular solute-binding protein  45.76 
 
 		 303 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  45.32 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07320  amino acid ABC transporter, perplasmic binding protein  46.67 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  43.82 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4438  extracellular solute-binding protein family 3  45.76 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.156595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  45.7 
 
 		 302 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  45.7 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  44.41 
 
 		 306 aa  245  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  44.6 
 
 		 297 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4329  extracellular solute-binding protein family 3  45.39 
 
 		 303 aa  245  8e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6965  extracellular solute-binding protein family 3  45.59 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0701  extracellular solute-binding protein  46.44 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2798  extracellular solute-binding protein  45.76 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610128  normal  0.6873 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  43.46 
 
 		 334 aa  242  7e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  43.49 
 
 		 298 aa  241  7.999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2190  extracellular solute-binding protein  44.03 
 
 		 306 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0938958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3932  extracellular solute-binding protein family 3  44.16 
 
 		 297 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05478  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  41.22 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  44.64 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5904  extracellular solute-binding protein  44.03 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4370  extracellular solute-binding protein  43.6 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2173  extracellular solute-binding protein  44.03 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  47.19 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  43.06 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  45.26 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5289  extracellular solute-binding protein  43.73 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  41.84 
 
 		 291 aa  235  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  44.94 
 
 		 313 aa  235  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3666  extracellular solute-binding protein family 3  43.84 
 
 		 301 aa  234  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  44.13 
 
 		 294 aa  234  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  41.52 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3343  extracellular solute-binding protein family 3  42.71 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  43.06 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  41.38 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3601  extracellular solute-binding protein family 3  45.72 
 
 		 304 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0485295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4535  extracellular solute-binding protein  46.98 
 
 		 304 aa  232  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223425  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  40.54 
 
 		 298 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  43.06 
 
 		 297 aa  231  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  42.12 
 
 		 298 aa  231  9e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  43.07 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  43.51 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  43.07 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  42.7 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  43.01 
 
 		 298 aa  230  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  43.81 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  40.2 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  40.88 
 
 		 302 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2920  glutamate and aspartate transporter subunit  40.13 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.847133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1127  extracellular solute-binding protein  43.82 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.164793  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1835  glutamate and aspartate transporter subunit  40.13 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  41.36 
 
 		 301 aa  228  8e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3010  glutamate and aspartate transporter subunit  40.13 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197195  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  43.45 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  42.09 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  42.09 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  41.75 
 
 		 302 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  43.45 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  42.09 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  43.45 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  43.45 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  43.45 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  43.42 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  43.45 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4081  extracellular solute-binding protein  41.33 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5742  extracellular solute-binding protein  41.33 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  43.01 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1100  extracellular solute-binding protein  45.96 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3806  extracellular solute-binding protein  41.33 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4562  extracellular solute-binding protein  41.33 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2261  putative amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  43.48 
 
 		 308 aa  225  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  43.07 
 
 		 302 aa  225  7e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  40.93 
 
 		 289 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1112  extracellular solute-binding protein  45.59 
 
 		 305 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.455507 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  42.25 
 
 		 299 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0084  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  39.8 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.767728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  42.91 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  42.91 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  43.07 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>