95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16650 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  546  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  39.53 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  40.34 
 
 
254 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  41.07 
 
 
254 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  39.83 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  37.4 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  39.61 
 
 
265 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  28.87 
 
 
279 aa  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  42.41 
 
 
266 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  37.05 
 
 
247 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  39.15 
 
 
260 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  39.42 
 
 
246 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  36.99 
 
 
246 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  35.98 
 
 
265 aa  99.4  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  33.86 
 
 
252 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  37.16 
 
 
248 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  34.5 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  34.48 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  35.23 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  35.41 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  33.73 
 
 
249 aa  89.4  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  37.5 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  34.7 
 
 
248 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  35.06 
 
 
272 aa  85.5  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  33.83 
 
 
251 aa  85.5  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  34.34 
 
 
252 aa  85.5  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  32.7 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  32.7 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  35.55 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  32.82 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  35.34 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  32.74 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  27.03 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1358  hypothetical protein  30.13 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0026  hypothetical protein  30.77 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.234225  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  27.23 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  24.67 
 
 
246 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  23.45 
 
 
246 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  24.23 
 
 
246 aa  53.5  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  30.26 
 
 
257 aa  52.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  27.6 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  25.65 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  30.56 
 
 
262 aa  49.7  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  24.68 
 
 
257 aa  48.9  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  31.91 
 
 
256 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  31.91 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  31.91 
 
 
257 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  31.91 
 
 
257 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4789  hypothetical protein  30.15 
 
 
260 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.287151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2372  hypothetical protein  29.21 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  30.41 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2729  hypothetical protein  29.24 
 
 
258 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0961  hypothetical protein  24.31 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2893  hypothetical protein  30.43 
 
 
257 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2896  hypothetical protein  25.97 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.423093  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  25.81 
 
 
257 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1090  hypothetical protein  32.69 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  31.69 
 
 
260 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0016  hypothetical protein  31.41 
 
 
257 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2644  hypothetical protein  29.29 
 
 
262 aa  46.2  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4436  hypothetical protein  26.38 
 
 
259 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1244  hypothetical protein  27.34 
 
 
259 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3291  hypothetical protein  29.29 
 
 
262 aa  46.2  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  27.04 
 
 
252 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1301  protein of unknown function DUF328  30 
 
 
261 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0896  hypothetical protein  28.06 
 
 
259 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453621  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1053  hypothetical protein  27.85 
 
 
257 aa  45.8  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1467  hypothetical protein  32.05 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000638991  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4560  hypothetical protein  28.06 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3665  hypothetical protein  27.46 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1064  hypothetical protein  27.34 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0828  hypothetical protein  29.29 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126561 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0444  hypothetical protein  32.05 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82979  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1330  hypothetical protein  32.05 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1321  hypothetical protein  32.05 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.522581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0708  hypothetical protein  32.05 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018816  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1161  hypothetical protein  32.05 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000956326  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  30.22 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0444  hypothetical protein  26.6 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  29.05 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3860  hypothetical protein  25.53 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  24.36 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1289  hypothetical protein  26.62 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.657969  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  29.58 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  31.65 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  26.95 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5283  hypothetical protein  27.22 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0804357  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  27.34 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  25.93 
 
 
258 aa  42.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  31.65 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  25.81 
 
 
257 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0482  hypothetical protein  26.45 
 
 
258 aa  42.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.520329  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  22.75 
 
 
258 aa  42.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2092  hypothetical protein  31.39 
 
 
257 aa  42.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.786423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0978  hypothetical protein  26.67 
 
 
261 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0474626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>