171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2146 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  100 
 
 		 247 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  59.76 
 
 		 251 aa  258  7e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  62.82 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  55.98 
 
 		 255 aa  235  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  56.1 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  55.42 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  55.82 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  56.36 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  56.36 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  58.54 
 
 		 249 aa  208  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  48.39 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  48.32 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  43.32 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  43.12 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  41.95 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  41.94 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  38.89 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  41.2 
 
 		 265 aa  129  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  39.6 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  40.83 
 
 		 258 aa  121  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  39.38 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  37.5 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  41.51 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  41.44 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  35.9 
 
 		 279 aa  115  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  38.03 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  31.78 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  37.34 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  28.7 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  29.57 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  38.64 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  40.43 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  41.48 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  30.38 
 
 		 270 aa  96.3  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  34.5 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  31.34 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  26.11 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  36.89 
 
 		 232 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  26.94 
 
 		 245 aa  85.5  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  29.05 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  26.94 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  31.28 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  33.66 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2652  hypothetical protein  32.29 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  28.15 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  26.92 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  31.76 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3824  hypothetical protein  31.33 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  32.05 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  27.04 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  25.86 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  27.32 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2729  hypothetical protein  25.11 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  23.91 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  23.91 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  27.32 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  23.91 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  25.65 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  29.8 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  24.79 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2896  hypothetical protein  26.18 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.423093  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  28.03 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  26.23 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  28.19 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  27.7 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  29.94 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  27.14 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  26.63 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  25.59 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  25.42 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  26.81 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08011  hypothetical protein  27.56 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  27.08 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  24.74 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  29.05 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  26.69 
 
 		 257 aa  62  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0482  hypothetical protein  25.1 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.520329  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1053  hypothetical protein  28.85 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1289  hypothetical protein  26.18 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.657969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4436  hypothetical protein  25.63 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  27.89 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0961  hypothetical protein  26.85 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1544  hypothetical protein  30 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0444  hypothetical protein  32.64 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  26.53 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1607  hypothetical protein  31.65 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1840  hypothetical protein  28.09 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360763  normal  0.0166065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1064  hypothetical protein  25.32 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2893  hypothetical protein  27.78 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4560  hypothetical protein  25.32 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11220  hypothetical protein  28.17 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92361  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0554  hypothetical protein  26.76 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2372  hypothetical protein  31.21 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0896  hypothetical protein  25.21 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18590  hypothetical protein  31.01 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0493865 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2547  hypothetical protein  26.35 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2499  hypothetical protein  26.75 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  27.21 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1244  hypothetical protein  25.5 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>