176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7087 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  53.11 
 
 
252 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  52.85 
 
 
265 aa  215  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  57.44 
 
 
246 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  45.28 
 
 
272 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  48.95 
 
 
251 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  45.37 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  44.93 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  45.6 
 
 
247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  49.55 
 
 
248 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  42.86 
 
 
248 aa  154  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  46.12 
 
 
248 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  44.59 
 
 
251 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  41.87 
 
 
260 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  42.92 
 
 
255 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  43.78 
 
 
258 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  45.66 
 
 
248 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  38.61 
 
 
263 aa  148  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  41.95 
 
 
247 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  46.73 
 
 
266 aa  141  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  47.98 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  47.98 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  38.53 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  40.96 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  46.33 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  41 
 
 
265 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  45.41 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  42.31 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  43.17 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  46.26 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  28.64 
 
 
246 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  29.13 
 
 
246 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  28.16 
 
 
246 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  36.99 
 
 
279 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  40.23 
 
 
232 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  27.14 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  30.63 
 
 
270 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  28.57 
 
 
245 aa  93.2  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  28.44 
 
 
247 aa  92.4  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  26.05 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  26.84 
 
 
241 aa  89  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  24.54 
 
 
248 aa  89  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11743  predicted protein  32.16 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.555211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  29.39 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  32.14 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  33.57 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1317  hypothetical protein  28.27 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0431  protein of unknown function DUF328  32.97 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000242237 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  30.97 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  27.75 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  31.41 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1320  hypothetical protein  29.07 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08011  hypothetical protein  28.12 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  32.54 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  28.74 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2547  hypothetical protein  32.86 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0542  hypothetical protein  24.06 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  29.82 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2896  hypothetical protein  33.12 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.423093  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  29.65 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  29.65 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  30.41 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0896  hypothetical protein  31.9 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453621  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  31.43 
 
 
259 aa  62.4  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2081  hypothetical protein  21.67 
 
 
243 aa  62  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  31.76 
 
 
262 aa  62  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  32.86 
 
 
257 aa  62  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3860  hypothetical protein  29.61 
 
 
257 aa  62  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  28.49 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  31.29 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  27.75 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  25.55 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1467  hypothetical protein  31.17 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000638991  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3665  hypothetical protein  30.92 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5283  hypothetical protein  32.85 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0804357  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3131  hypothetical protein  34.19 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.753755  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  31.45 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  27.27 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1161  hypothetical protein  31.17 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000956326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0708  hypothetical protein  31.17 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1321  hypothetical protein  31.17 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.522581  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1330  hypothetical protein  31.17 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0444  hypothetical protein  31.17 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82979  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  28.08 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  27.27 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  29.07 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  27.27 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  30 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0554  hypothetical protein  30.5 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2729  hypothetical protein  31.41 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4789  hypothetical protein  30.85 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.287151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  30.72 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1053  hypothetical protein  32.08 
 
 
257 aa  59.7  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  30.92 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1090  hypothetical protein  31.25 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3824  hypothetical protein  28.04 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1611  hypothetical protein  27.08 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2223  hypothetical protein  27.08 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  28.05 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  31.43 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>