161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5849 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  487  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  65.04 
 
 		 249 aa  264  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  55.98 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  59 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  60.59 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  58.06 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  56.85 
 
 		 248 aa  234  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  59.36 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  57.49 
 
 		 248 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  57.49 
 
 		 248 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  51.42 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  46.61 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  44.53 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  44.26 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  45.22 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  41.13 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  41.31 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  42.29 
 
 		 252 aa  141  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  41.74 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  39.09 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  43.75 
 
 		 247 aa  131  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  40.77 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  38.65 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  48.09 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  46.03 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  40.34 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  40.91 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  33.33 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  31.25 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  38.82 
 
 		 277 aa  101  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  35.41 
 
 		 279 aa  95.5  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  30.13 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  36.29 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  26.46 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  24.44 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  25.33 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  36.33 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  27.59 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  26.44 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  25.83 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  25.83 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  25.83 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  29.55 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  29.22 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  22.43 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  27.07 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  24.22 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2896  hypothetical protein  25.73 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.423093  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  28.18 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  26.27 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  28.45 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1053  hypothetical protein  25.29 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  26.89 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  21.81 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  26.2 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  27.07 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  26.2 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  26.46 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  26.46 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  26.2 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  26.47 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2729  hypothetical protein  26.45 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747307  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  25.35 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  29.39 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0007  hypothetical protein  25.86 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  27.98 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  25.77 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  23.25 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0482  hypothetical protein  23.76 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.520329  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  26.87 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2547  hypothetical protein  25.91 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  26.09 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3665  hypothetical protein  25.12 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  23.68 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00006  hypothetical protein  26.44 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3590  protein of unknown function DUF328  26.44 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1320  hypothetical protein  24.57 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0961  hypothetical protein  29.45 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3860  hypothetical protein  24.58 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00006  hypothetical protein  26.44 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0007  hypothetical protein  26.44 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.865833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0006  hypothetical protein  26.44 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3649  hypothetical protein  26.44 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0005  hypothetical protein  26.44 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  24.9 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  30.07 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  24.9 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  24.9 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0006  hypothetical protein  26.44 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  25.76 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  23.81 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  24.9 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1064  hypothetical protein  26.81 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  24.9 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08011  hypothetical protein  26.76 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2499  hypothetical protein  27.75 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  25.52 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  24.7 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  30.5 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>