170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14990 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  501  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  57.53 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  59.78 
 
 		 277 aa  257  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  62.16 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  56.06 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  54.96 
 
 		 254 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  56.2 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  54.26 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  45.86 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  44.26 
 
 		 251 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  45.08 
 
 		 272 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  36.1 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  43.78 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  46.03 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  41.42 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  47.41 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  45.09 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  42.13 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  45 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  42.13 
 
 		 248 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  41.88 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  44.55 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  40.83 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  42.59 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  39.83 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  42.59 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  42.25 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  39.77 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  40.87 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  35.83 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  42.2 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  29.82 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  25.65 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  39.45 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  24.78 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  23.04 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  28.31 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3665  hypothetical protein  26.87 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  25.46 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0542  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3860  hypothetical protein  25.44 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  29.66 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  28.92 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0536  protein of unknown function DUF328  25.83 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0568  hypothetical protein  27.51 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  26.38 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  27.95 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  26.38 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  27.95 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  27.95 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  27.95 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  27.95 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  26.38 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  28.26 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  30.61 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  26.52 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  32.68 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  26.47 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  19.84 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  27.07 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1375  hypothetical protein  26.51 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508327  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  25.99 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  25.33 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  26.87 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  28.1 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  26.05 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  28.1 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  28.1 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  27.59 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3824  hypothetical protein  28.86 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3180  hypothetical protein  26.51 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0791396  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  26.43 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  25.77 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  33.11 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  27.27 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  28.18 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0005  hypothetical protein  27.33 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0007  hypothetical protein  27.89 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  28.57 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00006  hypothetical protein  27.89 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3649  hypothetical protein  27.89 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  24.39 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00006  hypothetical protein  27.89 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0007  hypothetical protein  27.89 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.865833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0006  hypothetical protein  27.89 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1301  protein of unknown function DUF328  28.95 
 
 		 261 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  22.54 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1467  hypothetical protein  27.5 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000638991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  23.46 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1161  hypothetical protein  27.5 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000956326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0708  hypothetical protein  27.5 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1321  hypothetical protein  27.5 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.522581  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1330  hypothetical protein  27.5 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0444  hypothetical protein  27.5 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82979  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3590  protein of unknown function DUF328  27.59 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  29.03 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  24.42 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08011  hypothetical protein  25.74 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0637  hypothetical protein  28.07 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000248994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>