93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0435 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  100 
 
 		 246 aa  481  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  52.23 
 
 		 247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  52.65 
 
 		 246 aa  248  5e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  52.65 
 
 		 246 aa  248  6e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  52.24 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  50.82 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  50 
 
 		 245 aa  228  1e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  49.19 
 
 		 245 aa  221  7e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  40.98 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  30.09 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  27.14 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  26.67 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  29.03 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  26.11 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  26.91 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  25.96 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  27.31 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  24.66 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  25.23 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  23.47 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  27.11 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  24.8 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  23.08 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  24.43 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  23.83 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  25.4 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  25 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  22.17 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  21.13 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  28.06 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  28.06 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  22.83 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0604  protein of unknown function DUF328  28.28 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0200357  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  29.1 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  27.23 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  22.27 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  20.54 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2081  hypothetical protein  27.7 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  26.79 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0956  protein of unknown function DUF328  27.27 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0493  hypothetical protein  28.48 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000635683  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  21.54 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1568  hypothetical protein  30.67 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  28.76 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1764  hypothetical protein  24.89 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0121246 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11220  hypothetical protein  23.95 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92361  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08011  hypothetical protein  25.86 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  21.79 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0239  hypothetical protein  25.81 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000011533  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  27.1 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  28.06 
 
 		 232 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  28.67 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4560  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  25.45 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  28.1 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0896  hypothetical protein  23.89 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0519  protein of unknown function DUF328  31.93 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1611  hypothetical protein  24.56 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2223  hypothetical protein  24.56 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0554  hypothetical protein  28 
 
 		 270 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  24.15 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2247  hypothetical protein  24.26 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0637  hypothetical protein  27.63 
 
 		 270 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000248994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1064  hypothetical protein  26.14 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1054  hypothetical protein  21.99 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00231161  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0016  hypothetical protein  21.38 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1607  hypothetical protein  23.93 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  20.75 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  20.75 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  20.75 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  25.15 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  23.11 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2729  hypothetical protein  27.27 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747307  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4480  hypothetical protein  23.53 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487032  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  24.24 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  23.67 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2261  hypothetical protein  24.55 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2140  hypothetical protein  24.26 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540337  normal  0.546865 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  23.41 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  21.58 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  25 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2896  hypothetical protein  24.89 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.423093  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1244  hypothetical protein  24.42 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  24.55 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  20.59 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  22.98 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1289  hypothetical protein  25.15 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.657969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  20.68 
 
 		 257 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  20.68 
 
 		 257 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  20.68 
 
 		 257 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  20.68 
 
 		 257 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0482  hypothetical protein  23.75 
 
 		 258 aa  42  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.520329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>