111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0344 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  100 
 
 
247 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  52.23 
 
 
246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  48.78 
 
 
245 aa  230  2e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  46.77 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  46.77 
 
 
246 aa  210  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  42.86 
 
 
248 aa  210  1e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  46.15 
 
 
246 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  43.53 
 
 
245 aa  210  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  39.75 
 
 
241 aa  180  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  28.44 
 
 
246 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  31.53 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  31.8 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  30.73 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  29.61 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  31.34 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  30.13 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  29.82 
 
 
248 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  29.36 
 
 
248 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  29.36 
 
 
248 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  29.69 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  31.36 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  29.82 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  28.75 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  28.45 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  25.91 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  27.05 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  27.35 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  27.44 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  23.72 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  28.33 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  29.57 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  26.67 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  28.46 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  25.35 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  27.68 
 
 
270 aa  62.8  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  25.43 
 
 
266 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  24.41 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  24.42 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  27.03 
 
 
279 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  26.63 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0956  protein of unknown function DUF328  24.38 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0493  hypothetical protein  25.3 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000635683  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2499  hypothetical protein  22.63 
 
 
256 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  23.74 
 
 
248 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  25.51 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  26.32 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  25.37 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  25.31 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  24.48 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  29.01 
 
 
257 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  26.71 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0637  hypothetical protein  29.56 
 
 
270 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000248994  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  27.27 
 
 
258 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0604  protein of unknown function DUF328  26.14 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0200357  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2652  hypothetical protein  28.3 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  27.16 
 
 
259 aa  49.3  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  29.38 
 
 
257 aa  48.9  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  23.65 
 
 
257 aa  48.9  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0554  hypothetical protein  27.1 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0978  hypothetical protein  24.18 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  28.4 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  26.8 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1607  hypothetical protein  26.34 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  28.4 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  28.4 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  25 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0542  hypothetical protein  26.45 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1358  hypothetical protein  28.28 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0482  hypothetical protein  25.79 
 
 
258 aa  47  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.520329  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1764  hypothetical protein  27.92 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0121246 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0026  hypothetical protein  28.28 
 
 
257 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.234225  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4560  hypothetical protein  25.21 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  23.42 
 
 
260 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  29.63 
 
 
252 aa  46.2  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0896  hypothetical protein  26.71 
 
 
259 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453621  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  28.3 
 
 
252 aa  45.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  29.81 
 
 
257 aa  45.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1289  hypothetical protein  25.21 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.657969  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  25.15 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  28.75 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1568  hypothetical protein  25.48 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5283  hypothetical protein  28.4 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0804357  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  23.14 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2081  hypothetical protein  22.73 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  28.67 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  25.16 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4436  hypothetical protein  25 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  24.18 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  24.18 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  24.18 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  28.75 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0016  hypothetical protein  26.21 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  31.43 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0536  protein of unknown function DUF328  25.31 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2372  hypothetical protein  24.18 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2896  hypothetical protein  26.88 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.423093  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1053  hypothetical protein  28.57 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3590  protein of unknown function DUF328  25.65 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0006  hypothetical protein  25.86 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18590  hypothetical protein  25.51 
 
 
259 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0493865 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>