172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1496 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  100 
 
 		 263 aa  524  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  57.53 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  53.02 
 
 		 254 aa  221  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  52.53 
 
 		 277 aa  217  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  51.29 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  52.1 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  47.1 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  49.62 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  44.7 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  39.93 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  41.73 
 
 		 265 aa  155  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  33.08 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  38.61 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  42.49 
 
 		 251 aa  141  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  41.89 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  39.53 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  39.01 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  40.44 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  39.09 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  39.04 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  40.26 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  41.03 
 
 		 251 aa  122  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  37.5 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  38.29 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  32.44 
 
 		 252 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  39.23 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  40 
 
 		 248 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  40 
 
 		 248 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  40 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  33.18 
 
 		 270 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  41 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  40.47 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  40 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  26.07 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  26.07 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  26.54 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0542  hypothetical protein  25.55 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  27.44 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  29.92 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  23.83 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  29.57 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0637  hypothetical protein  28.1 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000248994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0604  protein of unknown function DUF328  25.93 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0200357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  29.81 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  23.11 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  31.66 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  30.13 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4560  hypothetical protein  30.19 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0444  hypothetical protein  31.75 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2140  hypothetical protein  26.8 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540337  normal  0.546865 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  28.37 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  26.98 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  26.55 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  28 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  28.07 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18590  hypothetical protein  29.06 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0493865 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  26.29 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  31.54 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2261  hypothetical protein  26.75 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  26.42 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  23.44 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1544  hypothetical protein  29.61 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0961  hypothetical protein  28.71 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1301  protein of unknown function DUF328  30.2 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4436  hypothetical protein  27.4 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0554  hypothetical protein  25.73 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  30.05 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  30.05 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  30.29 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  30.05 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1289  hypothetical protein  27.96 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.657969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1244  hypothetical protein  29.25 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1358  hypothetical protein  31.67 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1611  hypothetical protein  26.77 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2223  hypothetical protein  26.77 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0026  hypothetical protein  31.11 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.234225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  28.72 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  26.24 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  25.36 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  27.98 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1054  hypothetical protein  27.56 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00231161  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1064  hypothetical protein  27.39 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  28.11 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5283  hypothetical protein  29.71 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0804357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  24.45 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2092  hypothetical protein  34.52 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.786423 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0005  hypothetical protein  24.51 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1607  hypothetical protein  28.08 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  28.11 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  31.58 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0896  hypothetical protein  28.78 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2644  hypothetical protein  28.34 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3291  hypothetical protein  28.34 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  28.92 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0007  hypothetical protein  24 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  27.72 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00006  hypothetical protein  24 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0007  hypothetical protein  24 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.865833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0006  hypothetical protein  24 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  31.76 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>