145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12110 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  481  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  46.44 
 
 		 251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  42.86 
 
 		 246 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  46.06 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  43.53 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  44.63 
 
 		 254 aa  155  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  43.27 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  42.11 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  40.32 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  48.07 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  44.55 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  43.18 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  45.41 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  38.03 
 
 		 247 aa  121  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  41.52 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  45.58 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  39.51 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  40.91 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  34.59 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  40.47 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  39.82 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  39.66 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  42.13 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  39.09 
 
 		 248 aa  101  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  38.46 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  38.46 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  39.72 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  34.27 
 
 		 260 aa  92  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  30.47 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  36.86 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  36.11 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  36 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  21.63 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  28.51 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  22.33 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  22.33 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  26.18 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  28.95 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  29.29 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  29.28 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  24.2 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2140  hypothetical protein  30.64 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540337  normal  0.546865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  27.86 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2261  hypothetical protein  30.67 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  25.62 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  28.93 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1611  hypothetical protein  28.18 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2223  hypothetical protein  28.18 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0568  hypothetical protein  27.2 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  28.93 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  28.93 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  28.93 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  28.93 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1054  hypothetical protein  28.57 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00231161  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0007  hypothetical protein  27.33 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  25.74 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2247  hypothetical protein  28.33 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2644  hypothetical protein  30.21 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  29.03 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1301  protein of unknown function DUF328  30.63 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3291  hypothetical protein  30.21 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  27.84 
 
 		 257 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  29.03 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  25.32 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00006  hypothetical protein  27.33 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  29.03 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0007  hypothetical protein  27.33 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.865833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3649  hypothetical protein  27.33 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0005  hypothetical protein  27.33 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00006  hypothetical protein  27.33 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1467  hypothetical protein  30.5 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000638991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1161  hypothetical protein  30.5 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000956326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0708  hypothetical protein  30.5 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1330  hypothetical protein  30.5 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0444  hypothetical protein  30.5 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82979  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0006  hypothetical protein  27.33 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  28.21 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  29.51 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1090  hypothetical protein  30.5 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  22.9 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1321  hypothetical protein  30.5 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.522581  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  28.39 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0961  hypothetical protein  27.1 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3860  hypothetical protein  28.29 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0006  hypothetical protein  26.74 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  23.89 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3665  hypothetical protein  29.24 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3590  protein of unknown function DUF328  26.74 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3180  hypothetical protein  27.37 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0791396  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0482  hypothetical protein  27.65 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.520329  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1840  hypothetical protein  26.5 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360763  normal  0.0166065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  28.95 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1375  hypothetical protein  28.29 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508327  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2164  hypothetical protein  26.5 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0514757  normal  0.0821317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1064  hypothetical protein  25.32 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2729  hypothetical protein  28.76 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>