129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4987 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  100 
 
 		 252 aa  478  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  64.26 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  63.45 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  62.82 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  60.24 
 
 		 248 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  60.82 
 
 		 251 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  59.44 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  59.44 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  59.36 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  60.98 
 
 		 249 aa  228  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  53.85 
 
 		 248 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  46.86 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  48.13 
 
 		 251 aa  158  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  43.97 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  45.5 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  45.41 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  42.52 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  45.75 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  45 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  47.73 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  40 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  43.72 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  43.93 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  49.78 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  41.73 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  35.53 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  41.6 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  43.75 
 
 		 252 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  42.53 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  31.8 
 
 		 247 aa  95.5  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  40.93 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  36.61 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  31.02 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  27.27 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  30.49 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  26.79 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  25.23 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  25.84 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  39.52 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  24.43 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  23.64 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0604  protein of unknown function DUF328  26.76 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0200357  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  31.7 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  27.11 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  26.19 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  22.94 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  31.91 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2896  hypothetical protein  26.51 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.423093  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  29.79 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  24.89 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  24.89 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  24.89 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  29.79 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  28.37 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  28.24 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2927  hypothetical protein  29.06 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00365498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  28.24 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  28.24 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  27.63 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  28.24 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  25.86 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3131  hypothetical protein  32.91 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.753755  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0431  protein of unknown function DUF328  33.54 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000242237 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1358  hypothetical protein  30.86 
 
 		 257 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  29.91 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  30.88 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0026  hypothetical protein  31.76 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.234225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  29.08 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2658  hypothetical protein  30.43 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2729  hypothetical protein  26.62 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747307  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  25.55 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  25.97 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  26.95 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1053  hypothetical protein  25.58 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1320  hypothetical protein  26.92 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  25.32 
 
 		 258 aa  49.3  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  24.05 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1317  hypothetical protein  28.7 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08011  hypothetical protein  23.32 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0542  hypothetical protein  21.7 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2499  hypothetical protein  26.34 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  25.11 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3824  hypothetical protein  30.15 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4480  hypothetical protein  28.11 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487032  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2652  hypothetical protein  29.73 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0016  hypothetical protein  30.9 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  28 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0978  hypothetical protein  25.97 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  24.52 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2081  hypothetical protein  22.54 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  24.45 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  25.89 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  25.89 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  25.89 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  25.89 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0444  hypothetical protein  31.94 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  24.57 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  23.57 
 
 		 289 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  23.68 
 
 		 257 aa  45.4  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>