152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3273 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  86.69 
 
 
248 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  70.97 
 
 
248 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  70.97 
 
 
248 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  70.97 
 
 
248 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  64.26 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  60.59 
 
 
251 aa  244  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  55.42 
 
 
247 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  61.18 
 
 
249 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  60.34 
 
 
255 aa  230  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  59.17 
 
 
248 aa  220  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  47.28 
 
 
272 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  44.35 
 
 
251 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  45.66 
 
 
246 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  42.51 
 
 
265 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  38.82 
 
 
254 aa  141  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  44.4 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  40.37 
 
 
254 aa  135  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  43.28 
 
 
266 aa  131  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  39.69 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  39.53 
 
 
252 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  44.13 
 
 
247 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  38.16 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  42.25 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  35.93 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  45.69 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  41.59 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  37.85 
 
 
246 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  37.95 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  38.17 
 
 
248 aa  95.9  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  28 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  29.92 
 
 
247 aa  92.4  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  34.7 
 
 
279 aa  92.4  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  29.72 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  28.1 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  28.57 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  26.03 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  27.23 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  45.52 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  26.91 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  23.47 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  28.02 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  30.81 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  27.57 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  27.07 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  29.93 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  24.41 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  27.59 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  27.59 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  26.11 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  32.5 
 
 
267 aa  62.4  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  31.91 
 
 
252 aa  62  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  29.11 
 
 
257 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  24.89 
 
 
257 aa  62  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2729  hypothetical protein  24.58 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747307  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  26.72 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  27.16 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  26.52 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  26.06 
 
 
258 aa  59.3  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2896  hypothetical protein  25.43 
 
 
258 aa  59.3  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.423093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  27.1 
 
 
261 aa  58.5  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  24.24 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  24.62 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1317  hypothetical protein  26.32 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  28.74 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  26.83 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  26.22 
 
 
257 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3824  hypothetical protein  25.68 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08011  hypothetical protein  27.78 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1053  hypothetical protein  28.48 
 
 
257 aa  56.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1320  hypothetical protein  24.86 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  24.45 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2658  hypothetical protein  30.6 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  26.21 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  26.21 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  26.21 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  25 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  22.47 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2893  hypothetical protein  28.67 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11743  predicted protein  28.48 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.555211  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0431  protein of unknown function DUF328  31.58 
 
 
250 aa  52.4  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000242237 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  25.96 
 
 
257 aa  52.4  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2927  hypothetical protein  27.89 
 
 
263 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00365498  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  23.14 
 
 
289 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0444  hypothetical protein  30 
 
 
258 aa  52  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0482  hypothetical protein  26.21 
 
 
258 aa  52.4  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.520329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  25.86 
 
 
257 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  25 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  25.86 
 
 
257 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1358  hypothetical protein  30.49 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  25.86 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0026  hypothetical protein  30.49 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.234225  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  25.86 
 
 
257 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  25.86 
 
 
257 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2652  hypothetical protein  28.14 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  26.84 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2547  hypothetical protein  26.71 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  23.33 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0604  protein of unknown function DUF328  25.58 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0200357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2499  hypothetical protein  23.08 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>