82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0804 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  488  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  95.12 
 
 
246 aa  464  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  93.9 
 
 
246 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  52.65 
 
 
246 aa  248  6e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  48.98 
 
 
245 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  48.57 
 
 
245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  47.54 
 
 
248 aa  211  1e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  46.15 
 
 
247 aa  210  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  40.89 
 
 
241 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  28.7 
 
 
247 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  28.16 
 
 
246 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  29.57 
 
 
279 aa  95.1  8e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  27.78 
 
 
265 aa  95.1  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  25.59 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  27.4 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  26.67 
 
 
254 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  26.07 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  29.05 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  27.49 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  24.41 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  27.62 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  23.04 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  25.84 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  27.11 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  28.1 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  26.48 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  26.44 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  26.44 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  24.37 
 
 
270 aa  79  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  23.66 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  22.86 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  24.66 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  26.79 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  25 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  21.05 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  22.27 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  25.71 
 
 
265 aa  61.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  22.58 
 
 
277 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  21.63 
 
 
248 aa  58.5  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  20.66 
 
 
260 aa  58.5  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  23.45 
 
 
279 aa  55.8  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0431  protein of unknown function DUF328  24.54 
 
 
250 aa  55.8  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000242237 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1650  hypothetical protein  22.67 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0554  hypothetical protein  23.98 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1764  hypothetical protein  21.46 
 
 
256 aa  52.4  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0121246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0542  hypothetical protein  25.1 
 
 
266 aa  52  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0493  hypothetical protein  23.14 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000635683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  21.52 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  25.97 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  27.13 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1568  hypothetical protein  28.33 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1375  hypothetical protein  23.22 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508327  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  24.38 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0637  hypothetical protein  25 
 
 
270 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000248994  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  23.5 
 
 
258 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0026  hypothetical protein  19.21 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.234225  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  27.45 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1358  hypothetical protein  18.78 
 
 
257 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1054  hypothetical protein  24.07 
 
 
260 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00231161  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3180  hypothetical protein  23.08 
 
 
260 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0791396  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11743  predicted protein  21.57 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.555211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5283  hypothetical protein  21.61 
 
 
261 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0804357  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  24.55 
 
 
257 aa  45.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  19.4 
 
 
257 aa  45.4  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2247  hypothetical protein  20.95 
 
 
260 aa  45.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2372  hypothetical protein  21.79 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  20.68 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  22.33 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0896  hypothetical protein  21.26 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453621  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4560  hypothetical protein  20.77 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  22.03 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  25.64 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1289  hypothetical protein  20.77 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.657969  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  23.12 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  21.46 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0536  protein of unknown function DUF328  20.17 
 
 
260 aa  42.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4480  hypothetical protein  29.17 
 
 
255 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487032  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  25.64 
 
 
258 aa  42.7  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0016  hypothetical protein  17.97 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  27.66 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2644  hypothetical protein  20.38 
 
 
262 aa  42  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3291  hypothetical protein  20.38 
 
 
262 aa  41.6  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>