170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3327 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  100 
 
 		 247 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  53.31 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  54.26 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  50.62 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  53.05 
 
 		 266 aa  191  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  50.38 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  47.1 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  50.39 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  53.67 
 
 		 260 aa  171  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  45.6 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  49.15 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  48.52 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  46.06 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  46.54 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  41.51 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  46.88 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  46.95 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  45.3 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  45.45 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  40.62 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  43.75 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  44.65 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  35.15 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  44.13 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  41.51 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  45.45 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  45.45 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  47.51 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  43.96 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  37.05 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  31.88 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  40.97 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  40.15 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  28.44 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  23.33 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  23.33 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  22.86 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  29.37 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  28.38 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11743  predicted protein  27.19 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.555211  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1321  hypothetical protein  29.39 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.522581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1467  hypothetical protein  29.07 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000638991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1161  hypothetical protein  29.07 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000956326  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2092  hypothetical protein  38.25 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.786423 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0708  hypothetical protein  29.07 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1330  hypothetical protein  29.07 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0444  hypothetical protein  29.07 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82979  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  29.52 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  24.88 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1090  hypothetical protein  29.12 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2658  hypothetical protein  36.99 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  27.95 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2261  hypothetical protein  28.97 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  28.33 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2140  hypothetical protein  28.57 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540337  normal  0.546865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  28.07 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  26.69 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  25.78 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  22.9 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2247  hypothetical protein  27.43 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1611  hypothetical protein  27.78 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2223  hypothetical protein  27.78 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  26.22 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2372  hypothetical protein  30.04 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  28.73 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3713  hypothetical protein  29.02 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0291165  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  21.2 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  28.44 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  28.44 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  28.44 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  28.44 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  28.44 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  22.83 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2896  hypothetical protein  28.03 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.423093  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  34.2 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4789  hypothetical protein  36.96 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.287151 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  30.05 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1064  hypothetical protein  27.6 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08011  hypothetical protein  25.6 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  26.75 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1054  hypothetical protein  27.38 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00231161  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  25.54 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  24.89 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1375  hypothetical protein  32.18 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508327  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0568  hypothetical protein  25.52 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2652  hypothetical protein  31.44 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0961  hypothetical protein  26.18 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1032  hypothetical protein  31.65 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2893  hypothetical protein  27.13 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4560  hypothetical protein  28.51 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0604  protein of unknown function DUF328  26.83 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0200357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1607  hypothetical protein  27.04 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  29.39 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  28.19 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0444  hypothetical protein  34.69 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0791396  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0482  hypothetical protein  24.36 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.520329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3291  hypothetical protein  31.98 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2644  hypothetical protein  31.98 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  28.81 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>