163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0381 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  33.18 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  30.63 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  31.06 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  30.53 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  32.17 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  31.88 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  31.25 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  32.44 
 
 		 248 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  30.38 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  30.63 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  29.2 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  29.82 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  28.74 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  31.56 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  31.56 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  30.67 
 
 		 248 aa  89  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  29.44 
 
 		 272 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  31.08 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  29.44 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  30.49 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  30.68 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  25.96 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  25.73 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  24.9 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  24.37 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  32.56 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  27.23 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  28.52 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  31.17 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  25.65 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  27.59 
 
 		 246 aa  72  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  25.24 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  23.5 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  27.43 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  33.12 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  30.12 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  29.81 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2372  hypothetical protein  29.41 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  29.01 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0536  protein of unknown function DUF328  31.91 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  27.68 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  29.17 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1064  hypothetical protein  31.21 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2658  hypothetical protein  29.73 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  27.98 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1053  hypothetical protein  29.76 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  26.99 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11743  predicted protein  26.48 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.555211  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1320  hypothetical protein  25.55 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1317  hypothetical protein  25.55 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  27.98 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  25.13 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  28.37 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4560  hypothetical protein  28.92 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  34.62 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3166  hypothetical protein  28.48 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.819835  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1289  hypothetical protein  29.08 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.657969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0016  hypothetical protein  28.31 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0568  hypothetical protein  31.16 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4436  hypothetical protein  27.11 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  normal  0.857589 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3590  protein of unknown function DUF328  30.66 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1244  hypothetical protein  28.74 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0961  hypothetical protein  30.71 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1358  hypothetical protein  27.6 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18590  hypothetical protein  29.66 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0493865 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0026  hypothetical protein  27.6 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.234225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1032  hypothetical protein  30.5 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1607  hypothetical protein  31.21 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0006  hypothetical protein  30.66 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  28.4 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  30.5 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  25.9 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0896  hypothetical protein  28.31 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  27.23 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0007  hypothetical protein  30.66 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  25.9 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  30.18 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00006  hypothetical protein  30.66 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0005  hypothetical protein  30.66 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3649  hypothetical protein  30.66 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00006  hypothetical protein  30.66 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0604  protein of unknown function DUF328  23.86 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0200357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0006  hypothetical protein  30.66 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0007  hypothetical protein  30.66 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.865833  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0542  hypothetical protein  25.77 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2247  hypothetical protein  27.88 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3117  hypothetical protein  26.67 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08011  hypothetical protein  29.93 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  27.87 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  27.88 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1764  hypothetical protein  29.68 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0121246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  27.98 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>