118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2790 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  100 
 
 		 248 aa  472  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  58.85 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  59.17 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  55.37 
 
 		 248 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  53.85 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  51.42 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  48.39 
 
 		 247 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  55.37 
 
 		 248 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  55.37 
 
 		 248 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  51.42 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  50 
 
 		 249 aa  185  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  45.12 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  46.73 
 
 		 246 aa  151  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  49.77 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  43.41 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  41.08 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  44.25 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  39.42 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  43.06 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  41.2 
 
 		 263 aa  122  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  42.92 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  41.49 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  39.91 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  29.61 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  39.81 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  33.81 
 
 		 279 aa  95.1  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  26.52 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  26.96 
 
 		 246 aa  92.4  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  44.2 
 
 		 260 aa  91.7  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  34.86 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  40.66 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  39.38 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  24.8 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  28.91 
 
 		 245 aa  89  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  26.52 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  32.44 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  22.94 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  36.11 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  34.73 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  23.32 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  39.27 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  23.35 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  26.32 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  30.52 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  25.82 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  27.23 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  27.01 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2927  hypothetical protein  35.54 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00365498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  29.11 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  35.29 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  27.52 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  25.14 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  29.3 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  26.49 
 
 		 260 aa  52.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1568  hypothetical protein  23.81 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3131  hypothetical protein  33.73 
 
 		 285 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.753755  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  25.7 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  24.19 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0482  hypothetical protein  24.53 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.520329  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  24.71 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  27.16 
 
 		 261 aa  48.9  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  24.26 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  28.48 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1064  hypothetical protein  28.07 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  26.79 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1544  hypothetical protein  37.5 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2896  hypothetical protein  28.47 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.423093  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1244  hypothetical protein  28.86 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  26.25 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2499  hypothetical protein  25.56 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  30.32 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0961  hypothetical protein  25.6 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2658  hypothetical protein  29.33 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2547  hypothetical protein  24.34 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  26.32 
 
 		 257 aa  45.4  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08011  hypothetical protein  26.39 
 
 		 254 aa  45.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  23.26 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  26.47 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3291  hypothetical protein  26.9 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4436  hypothetical protein  26.85 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1607  hypothetical protein  27.63 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  22.33 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  22.33 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  22.33 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  25.54 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  25.54 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  25.54 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  25.54 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  25.54 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2644  hypothetical protein  26.9 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1358  hypothetical protein  30.73 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2729  hypothetical protein  27.04 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747307  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  24.84 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0026  hypothetical protein  31.28 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.234225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1053  hypothetical protein  26.06 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0536  protein of unknown function DUF328  26.49 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4480  hypothetical protein  31.47 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487032  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0568  hypothetical protein  24.32 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0493  hypothetical protein  21.24 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000635683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>