146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1285 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  496  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  53.69 
 
 
245 aa  259  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  50.82 
 
 
246 aa  238  6.999999999999999e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  50 
 
 
246 aa  232  5e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  48.77 
 
 
246 aa  225  6e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  50.41 
 
 
245 aa  223  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  47.54 
 
 
246 aa  218  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  43.27 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  43.85 
 
 
241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  24.42 
 
 
246 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  25.94 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  26.48 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  26.36 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  25.65 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  23.96 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  24.09 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  22.47 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  25.36 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  21.37 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  23 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  23.44 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  24.2 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  23.9 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  24 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  23.64 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  23.11 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0554  hypothetical protein  29.38 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  24.26 
 
 
272 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  25.22 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  23.61 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  21.81 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2081  hypothetical protein  29.68 
 
 
243 aa  62  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  22.43 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  23.53 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  22.87 
 
 
279 aa  61.2  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4560  hypothetical protein  28.99 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1607  hypothetical protein  27.75 
 
 
259 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0896  hypothetical protein  28.4 
 
 
259 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453621  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  27.27 
 
 
265 aa  59.3  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  31.11 
 
 
232 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  23.15 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  23.15 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2499  hypothetical protein  26.42 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  20.85 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  26.72 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18590  hypothetical protein  28.57 
 
 
259 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0493865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1032  hypothetical protein  28.83 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  29.19 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1064  hypothetical protein  27.61 
 
 
259 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2247  hypothetical protein  26.38 
 
 
260 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1244  hypothetical protein  27.61 
 
 
259 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3180  hypothetical protein  26.35 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0791396  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  23.33 
 
 
277 aa  55.8  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0961  hypothetical protein  28.83 
 
 
259 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  29.81 
 
 
257 aa  55.5  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  27.27 
 
 
257 aa  55.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  26.99 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0542  hypothetical protein  29.68 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1611  hypothetical protein  26.38 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2223  hypothetical protein  26.38 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2164  hypothetical protein  25.45 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0514757  normal  0.0821317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1840  hypothetical protein  25.45 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360763  normal  0.0166065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1054  hypothetical protein  25.77 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00231161  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0978  hypothetical protein  24.4 
 
 
261 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  29.81 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  26.38 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1375  hypothetical protein  25.31 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508327  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1289  hypothetical protein  27.22 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.657969  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  28.12 
 
 
258 aa  52.4  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11220  hypothetical protein  25.73 
 
 
259 aa  52.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92361  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  30 
 
 
256 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0637  hypothetical protein  26.67 
 
 
270 aa  52.4  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000248994  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  30 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  30 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0016  hypothetical protein  22.09 
 
 
257 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0536  protein of unknown function DUF328  27.33 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2261  hypothetical protein  24.84 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4436  hypothetical protein  27.33 
 
 
259 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  25.3 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  29.38 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2140  hypothetical protein  25.93 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540337  normal  0.546865 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1467  hypothetical protein  26.38 
 
 
260 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000638991  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2658  hypothetical protein  26.14 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  25 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1161  hypothetical protein  26.38 
 
 
260 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000956326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0708  hypothetical protein  26.38 
 
 
260 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0026  hypothetical protein  23.31 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.234225  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1321  hypothetical protein  26.38 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.522581  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1330  hypothetical protein  26.38 
 
 
260 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0444  hypothetical protein  26.38 
 
 
260 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  25.15 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  25.15 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  25.15 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0604  protein of unknown function DUF328  25.84 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0200357  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  24.38 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1090  hypothetical protein  26.38 
 
 
260 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0007  hypothetical protein  28.24 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132956  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0005  hypothetical protein  28.24 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3860  hypothetical protein  25.44 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0568  hypothetical protein  25.21 
 
 
257 aa  49.7  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255606  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>