87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0642 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  48.78 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  50 
 
 		 246 aa  228  1e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  49.18 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  50.41 
 
 		 248 aa  221  8e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  48.57 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  48.98 
 
 		 246 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  48.98 
 
 		 246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  48.78 
 
 		 245 aa  214  9e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  31.02 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  29.72 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  32.26 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  29.05 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  28.44 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  29.63 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  27.19 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  28.91 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  25 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  27.44 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  25 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  27.23 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  27.68 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  27.68 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  24.23 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  27.4 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  23.95 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  26.42 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  26.39 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  25.35 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  27.38 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  24.42 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  23.61 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  25.86 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  23.94 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  24.15 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  23.89 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1764  hypothetical protein  28.04 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0121246 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  26.07 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  29.3 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  26.28 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0604  protein of unknown function DUF328  28.21 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0200357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  25.66 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  26.32 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5283  hypothetical protein  24.75 
 
 		 261 aa  48.5  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0804357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  27.56 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  22.9 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  26.62 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0542  hypothetical protein  23.65 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1053  hypothetical protein  27.74 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  24.85 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  24.84 
 
 		 257 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  24.84 
 
 		 256 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  24.84 
 
 		 257 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  26.92 
 
 		 257 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  23.86 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1317  hypothetical protein  24.76 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  25.97 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  23.46 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4436  hypothetical protein  25.49 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0637  hypothetical protein  24.6 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000248994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0493  hypothetical protein  25.95 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000635683  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2372  hypothetical protein  23.49 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4480  hypothetical protein  26.35 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487032  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  24.84 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  27.65 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  25.95 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  24.68 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18590  hypothetical protein  27.46 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0493865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3713  hypothetical protein  28.95 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0291165  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1320  hypothetical protein  25.15 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3166  hypothetical protein  24.55 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.819835  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0554  hypothetical protein  27.03 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2499  hypothetical protein  25.32 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  26.82 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1607  hypothetical protein  25.81 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1611  hypothetical protein  25.95 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2223  hypothetical protein  25.95 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2140  hypothetical protein  26 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540337  normal  0.546865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1244  hypothetical protein  23.49 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  25.32 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2247  hypothetical protein  24.84 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1650  hypothetical protein  25.49 
 
 		 258 aa  42  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4560  hypothetical protein  23.78 
 
 		 259 aa  42  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2261  hypothetical protein  26 
 
 		 260 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  27.27 
 
 		 289 aa  41.6  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>