164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0872 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  100 
 
 		 279 aa  573  1.0000000000000001e-162  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  35.94 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  39.06 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  36.1 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  33.08 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  36.05 
 
 		 254 aa  148  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  35.37 
 
 		 265 aa  145  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  34.75 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  40.17 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  38.53 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  37.5 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  36.75 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  39.33 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  35.59 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  35.15 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  35.8 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  33.91 
 
 		 251 aa  118  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  35.93 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  35.17 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  35.9 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  33.9 
 
 		 248 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  31.06 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  37.71 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  28.87 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  33.47 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  33.47 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  34.21 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  32.05 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  30.77 
 
 		 252 aa  95.9  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  29.57 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  29.31 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  29.31 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  32.14 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  32.38 
 
 		 248 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  27.11 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  30.67 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  29.41 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  23.56 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  34.11 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  26.67 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  35.2 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  35.2 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  35.2 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  35.2 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  35.2 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3180  hypothetical protein  29.2 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0791396  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0568  hypothetical protein  33.6 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1375  hypothetical protein  30.71 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508327  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  32 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  30.19 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  30.19 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  30.19 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3860  hypothetical protein  32 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0536  protein of unknown function DUF328  32.8 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  32 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00006  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3590  protein of unknown function DUF328  33.33 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  27.12 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3649  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3665  hypothetical protein  32 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00006  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0007  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0007  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.865833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0006  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0006  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0542  hypothetical protein  24.27 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1467  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000638991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1161  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000956326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0708  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1330  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0444  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1090  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  29.41 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1321  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.522581  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  28.8 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0554  hypothetical protein  30.26 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  28.8 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0604  protein of unknown function DUF328  24.1 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0200357  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  27.18 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  29.56 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  30 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  30.4 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  28.35 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  28.35 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  25.86 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  25.29 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2547  hypothetical protein  27.2 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  28.93 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  24.9 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0637  hypothetical protein  29.41 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000248994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  30 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2247  hypothetical protein  28.35 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1611  hypothetical protein  28.35 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2223  hypothetical protein  28.35 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  28.3 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  22.42 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  29.03 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2140  hypothetical protein  28.35 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540337  normal  0.546865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1054  hypothetical protein  27.56 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00231161  normal  0.551617 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>