165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2082 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  100 
 
 		 277 aa  526  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  59.78 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  61.89 
 
 		 266 aa  239  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  52.53 
 
 		 263 aa  223  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  53.97 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  54.87 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  53.78 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  50.39 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  39.06 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  46.12 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  53.15 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  43.44 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  45.65 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  42.15 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  43.3 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  44.19 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  43.75 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  43.04 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  41.59 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  42.56 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  39.09 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  45.58 
 
 		 248 aa  109  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  39.09 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  41.86 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  40.09 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  29.2 
 
 		 270 aa  99.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  40.47 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  40.47 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  35.98 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  41.98 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  37.71 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  40.09 
 
 		 232 aa  89  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  38.91 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0542  hypothetical protein  25.65 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  22.22 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0554  hypothetical protein  24.79 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  23.96 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3824  hypothetical protein  31.33 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  22.58 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  28.11 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0568  hypothetical protein  28.49 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0536  protein of unknown function DUF328  29.27 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0026  hypothetical protein  35.21 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.234225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1358  hypothetical protein  34.51 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  27.81 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0005  hypothetical protein  26.92 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  30.12 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  25.52 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0007  hypothetical protein  27.07 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132956  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00006  hypothetical protein  27.07 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3649  hypothetical protein  27.07 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  30.46 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  30.46 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  30.46 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  30.46 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00006  hypothetical protein  27.07 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0007  hypothetical protein  27.07 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.865833  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  30.46 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  28.12 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  28.48 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  26.32 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0006  hypothetical protein  28.19 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  30.72 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1320  hypothetical protein  24.73 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3665  hypothetical protein  29.11 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  29.66 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4436  hypothetical protein  28.67 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0006  hypothetical protein  27.61 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3590  protein of unknown function DUF328  29.01 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  29.59 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1317  hypothetical protein  24.04 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  28 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0444  hypothetical protein  30.92 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0637  hypothetical protein  24.5 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000248994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  28 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  22.43 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  28 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  26.61 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  28.81 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  34.21 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  29.33 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3860  hypothetical protein  28 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  23.81 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  27.45 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3713  hypothetical protein  26.96 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0291165  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1375  hypothetical protein  28.67 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508327  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4560  hypothetical protein  28.57 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3180  hypothetical protein  29.78 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0791396  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08011  hypothetical protein  26.17 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  30.86 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2247  hypothetical protein  29.28 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3291  hypothetical protein  31.45 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  27.63 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  30.77 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  26.53 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>