121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10150 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  489  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  65.04 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  59.76 
 
 		 248 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  60.25 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  59.76 
 
 		 248 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  59.76 
 
 		 248 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  61.18 
 
 		 248 aa  249  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  60.98 
 
 		 252 aa  241  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  55.47 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  51.41 
 
 		 247 aa  225  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  50 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  46.28 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  48.23 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  44.86 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  44.98 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  42.31 
 
 		 246 aa  144  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  40.32 
 
 		 265 aa  135  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  44.3 
 
 		 260 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  38.84 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  38.79 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  41.77 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  43.72 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  40.18 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  36.51 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  44.24 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  39.66 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  42.19 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  34.78 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  38.99 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  35.47 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  33.85 
 
 		 279 aa  98.6  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  31.62 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  27.57 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  26.46 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  25.89 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  26.91 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  36.99 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  26.98 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  24.19 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  22.48 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1320  hypothetical protein  28.26 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1317  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  30.07 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  25.52 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0978  hypothetical protein  28.07 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  24.66 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  25.56 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  26.75 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  27.7 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  25.24 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1544  hypothetical protein  28.29 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2652  hypothetical protein  30.86 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  32.14 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1014  hypothetical protein  27.41 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  23.95 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  23.95 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  23.95 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  23.95 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  23.95 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  24.78 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  30.41 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2658  hypothetical protein  26.91 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  27.34 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3665  hypothetical protein  23.32 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  21.99 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  21.99 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  21.99 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3860  hypothetical protein  23.21 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2407  hypothetical protein  25.64 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2499  hypothetical protein  24.66 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  21.97 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2896  hypothetical protein  22.27 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.423093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3291  hypothetical protein  27.74 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2644  hypothetical protein  27.74 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2081  hypothetical protein  23.61 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4789  hypothetical protein  32.02 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.287151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2164  hypothetical protein  28.11 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0514757  normal  0.0821317 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08011  hypothetical protein  25.29 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1840  hypothetical protein  28.11 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360763  normal  0.0166065 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2119  hypothetical protein  24.84 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  30.46 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  25.15 
 
 		 257 aa  45.4  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3824  hypothetical protein  29.17 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  31.88 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  23.53 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1375  hypothetical protein  24.66 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508327  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3180  hypothetical protein  24.64 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0791396  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  25.9 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  24.64 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1053  hypothetical protein  26.62 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0431  protein of unknown function DUF328  31.53 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000242237 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2547  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  24.11 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0961  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  23.85 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0568  hypothetical protein  23.35 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0604  protein of unknown function DUF328  24.43 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0200357  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2092  hypothetical protein  29.08 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.786423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  24.46 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>