148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2016 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  485  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  48.68 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  47.28 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  47.28 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  48.95 
 
 		 246 aa  191  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  48.05 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  48.29 
 
 		 260 aa  188  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  48.32 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  48.8 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  44.98 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  49.09 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  46.44 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  47.74 
 
 		 246 aa  168  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  44.8 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  48.95 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  46.28 
 
 		 249 aa  162  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  44.35 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  48.13 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  46.44 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  46.8 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  46.8 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  44.26 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  42.49 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  47.98 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  48.62 
 
 		 248 aa  141  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  43.33 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  45.26 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  35.62 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  38.63 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  32.17 
 
 		 270 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  37.4 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  39.48 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  27.4 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  29.03 
 
 		 246 aa  95.5  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  27.54 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  27.54 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  29.82 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  22.27 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  29.57 
 
 		 258 aa  72  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  26.39 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  26.96 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  26.43 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  26.69 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  31.18 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  29.5 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2658  hypothetical protein  31.47 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  24.66 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  32.35 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  25.9 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  28.99 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  25.9 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  25.9 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  30.56 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0956  protein of unknown function DUF328  24.77 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  24.9 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  28.26 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  28.26 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  28.47 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  28.26 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  28.78 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  30.26 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  23.25 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  27.54 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  23.68 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0482  hypothetical protein  25.59 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.520329  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  22.03 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  29.5 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  27.54 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0026  hypothetical protein  29.7 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.234225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1358  hypothetical protein  29.09 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3180  hypothetical protein  28.97 
 
 		 260 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0791396  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  29.29 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2729  hypothetical protein  27.34 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747307  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1375  hypothetical protein  28.28 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508327  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3291  hypothetical protein  26.03 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2644  hypothetical protein  26.03 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  25.9 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  26.22 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  26.03 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  26.22 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  26.22 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  26.22 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  26.22 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1053  hypothetical protein  28.77 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  27.86 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1544  hypothetical protein  30 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08011  hypothetical protein  24.56 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0536  protein of unknown function DUF328  25.86 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2164  hypothetical protein  27.4 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0514757  normal  0.0821317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  24.26 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0978  hypothetical protein  26.01 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  25.18 
 
 		 289 aa  48.9  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1064  hypothetical protein  25.9 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0896  hypothetical protein  26.03 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2092  hypothetical protein  29.45 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.786423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  28.19 
 
 		 252 aa  48.5  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0961  hypothetical protein  26.62 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1840  hypothetical protein  26.71 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360763  normal  0.0166065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4789  hypothetical protein  28.15 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.287151 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>