155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4789 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4789  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.287151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3291  hypothetical protein  71.6 
 
 
262 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2644  hypothetical protein  71.21 
 
 
262 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  69.65 
 
 
259 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5283  hypothetical protein  69.11 
 
 
261 aa  351  8e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0804357  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2372  hypothetical protein  64.73 
 
 
259 aa  347  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3713  hypothetical protein  63.32 
 
 
258 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0291165  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  64.2 
 
 
257 aa  323  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2652  hypothetical protein  62.35 
 
 
257 aa  322  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1301  protein of unknown function DUF328  62.55 
 
 
261 aa  319  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3166  hypothetical protein  61.96 
 
 
258 aa  319  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.819835  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2164  hypothetical protein  62.11 
 
 
257 aa  315  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0514757  normal  0.0821317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1840  hypothetical protein  61.72 
 
 
257 aa  314  9e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360763  normal  0.0166065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2092  hypothetical protein  62.45 
 
 
257 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.786423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0978  hypothetical protein  57.92 
 
 
261 aa  295  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1014  hypothetical protein  56.76 
 
 
261 aa  289  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2893  hypothetical protein  55.25 
 
 
257 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3860  hypothetical protein  55.29 
 
 
257 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3180  hypothetical protein  56.59 
 
 
260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0791396  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1375  hypothetical protein  55.43 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508327  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  53.12 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  57.85 
 
 
261 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1054  hypothetical protein  55.04 
 
 
260 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00231161  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1244  hypothetical protein  54.47 
 
 
259 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1289  hypothetical protein  55.6 
 
 
259 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.657969  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0005  hypothetical protein  54.51 
 
 
258 aa  280  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4560  hypothetical protein  54.83 
 
 
259 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1064  hypothetical protein  53.91 
 
 
259 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  54.65 
 
 
260 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3665  hypothetical protein  54.51 
 
 
257 aa  279  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0896  hypothetical protein  54.05 
 
 
259 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453621  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4436  hypothetical protein  55.21 
 
 
259 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2261  hypothetical protein  55.77 
 
 
260 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00006  hypothetical protein  54.12 
 
 
258 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1090  hypothetical protein  55.56 
 
 
260 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1611  hypothetical protein  54.65 
 
 
260 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00006  hypothetical protein  54.12 
 
 
258 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2223  hypothetical protein  54.65 
 
 
260 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  52.94 
 
 
257 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1607  hypothetical protein  54.26 
 
 
259 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3649  hypothetical protein  54.12 
 
 
258 aa  276  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0007  hypothetical protein  54.12 
 
 
258 aa  276  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.865833  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0006  hypothetical protein  54.12 
 
 
258 aa  276  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2140  hypothetical protein  55 
 
 
260 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540337  normal  0.546865 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1467  hypothetical protein  55.56 
 
 
260 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000638991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1161  hypothetical protein  55.56 
 
 
260 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000956326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0708  hypothetical protein  55.56 
 
 
260 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1330  hypothetical protein  55.56 
 
 
260 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0444  hypothetical protein  55.56 
 
 
260 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0007  hypothetical protein  53.73 
 
 
258 aa  275  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132956  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2547  hypothetical protein  51.56 
 
 
259 aa  275  7e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3590  protein of unknown function DUF328  53.73 
 
 
258 aa  274  8e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0006  hypothetical protein  53.73 
 
 
258 aa  275  8e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  54.26 
 
 
260 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1321  hypothetical protein  55.17 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.522581  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2247  hypothetical protein  54.26 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  52.94 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  52.94 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  52.94 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0961  hypothetical protein  52.94 
 
 
259 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18590  hypothetical protein  53.88 
 
 
259 aa  272  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0493865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1032  hypothetical protein  54.65 
 
 
259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  49.42 
 
 
289 aa  271  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0536  protein of unknown function DUF328  54.12 
 
 
260 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  50.39 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2499  hypothetical protein  51.76 
 
 
256 aa  268  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  50.98 
 
 
258 aa  267  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  52.55 
 
 
257 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0482  hypothetical protein  49.8 
 
 
258 aa  266  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.520329  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0568  hypothetical protein  52.55 
 
 
257 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255606  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  52.55 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  52.55 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  52.55 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  52.16 
 
 
257 aa  265  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  50.98 
 
 
258 aa  265  5.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11220  hypothetical protein  52.71 
 
 
259 aa  265  7e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92361  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  52.55 
 
 
257 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  50 
 
 
257 aa  262  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2729  hypothetical protein  51.76 
 
 
258 aa  256  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747307  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  51.37 
 
 
257 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2896  hypothetical protein  49.02 
 
 
258 aa  254  8e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.423093  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3824  hypothetical protein  47.66 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  50.39 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  48.83 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1650  hypothetical protein  50.39 
 
 
258 aa  252  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  49.61 
 
 
262 aa  251  9.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  47.86 
 
 
257 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  48.65 
 
 
258 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  47.47 
 
 
257 aa  249  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0542  hypothetical protein  47.51 
 
 
266 aa  249  4e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  48.05 
 
 
257 aa  248  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  47.47 
 
 
257 aa  247  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  47.27 
 
 
257 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  48.83 
 
 
257 aa  247  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  47.84 
 
 
257 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  47.45 
 
 
256 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  46.88 
 
 
257 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  47.08 
 
 
257 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4480  hypothetical protein  50.39 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487032  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1053  hypothetical protein  47.08 
 
 
257 aa  243  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>