138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0956 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0956  protein of unknown function DUF328  100 
 
 
232 aa  456  1e-127  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1946  hypothetical protein  48.42 
 
 
267 aa  194  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.877875  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2081  hypothetical protein  43.5 
 
 
243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0493  hypothetical protein  31.85 
 
 
249 aa  95.1  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000635683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0604  protein of unknown function DUF328  29.51 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0200357  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0519  protein of unknown function DUF328  30.43 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  26.03 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  28.22 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1568  hypothetical protein  27.31 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  25.51 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0431  protein of unknown function DUF328  24.41 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000242237 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04620  hypothetical protein  23.55 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.1961  hitchhiker  0.000000338147 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0016  hypothetical protein  24.41 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  26.02 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11743  predicted protein  27.59 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.555211  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  26.69 
 
 
257 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  24.38 
 
 
289 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1320  hypothetical protein  28.78 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  25.1 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4789  hypothetical protein  21.76 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.287151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  25 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  27.24 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  26.02 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  24.59 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  24.79 
 
 
258 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  24.59 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2407  hypothetical protein  28.22 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  24.7 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0828  hypothetical protein  26.05 
 
 
263 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126561 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  24.59 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  23.58 
 
 
257 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  24.6 
 
 
259 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1317  hypothetical protein  28.22 
 
 
257 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0239  hypothetical protein  26.56 
 
 
251 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000011533  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2119  hypothetical protein  26.73 
 
 
254 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  26.59 
 
 
252 aa  62.4  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  23.95 
 
 
257 aa  62.4  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  25.64 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1764  hypothetical protein  25.54 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0121246 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  22.41 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3713  hypothetical protein  24.32 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0291165  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2896  hypothetical protein  24.48 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.423093  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  22.73 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  26.58 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2729  hypothetical protein  24.79 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747307  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4480  hypothetical protein  24.89 
 
 
255 aa  58.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487032  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08011  hypothetical protein  25.41 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  24.29 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3824  hypothetical protein  24.48 
 
 
256 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1053  hypothetical protein  25.83 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  25.25 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00006  hypothetical protein  26.05 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1244  hypothetical protein  22.13 
 
 
259 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1650  hypothetical protein  23.46 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  27.71 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3166  hypothetical protein  26.29 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.819835  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00006  hypothetical protein  26.05 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0007  hypothetical protein  26.05 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.865833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0006  hypothetical protein  26.05 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3131  hypothetical protein  22.4 
 
 
285 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.753755  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3649  hypothetical protein  26.05 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0007  hypothetical protein  26.05 
 
 
258 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132956  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0026  hypothetical protein  20.25 
 
 
257 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.234225  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29278  predicted protein  21.19 
 
 
294 aa  56.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0005  hypothetical protein  26.05 
 
 
258 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2927  hypothetical protein  21.88 
 
 
263 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00365498  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3291  hypothetical protein  20.32 
 
 
262 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  23.14 
 
 
257 aa  55.5  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2644  hypothetical protein  20.32 
 
 
262 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2372  hypothetical protein  26.9 
 
 
259 aa  55.1  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3590  protein of unknown function DUF328  25.63 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1358  hypothetical protein  21.61 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  24.38 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0006  hypothetical protein  25.63 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2547  hypothetical protein  23.92 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  22.62 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  22.62 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  22.62 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  22.62 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0568  hypothetical protein  24.37 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255606  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  23.76 
 
 
267 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  25.39 
 
 
262 aa  53.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0637  hypothetical protein  25.19 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000248994  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2652  hypothetical protein  23.39 
 
 
257 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  27.27 
 
 
246 aa  53.1  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  22.62 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5283  hypothetical protein  23.29 
 
 
261 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0804357  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  24.54 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  26.09 
 
 
261 aa  51.6  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0536  protein of unknown function DUF328  24.53 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0554  hypothetical protein  24.06 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2092  hypothetical protein  22.22 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.786423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  24.29 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  23.33 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2893  hypothetical protein  25.47 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0482  hypothetical protein  22.96 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.520329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  23.02 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  23.02 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  23.02 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1064  hypothetical protein  25.57 
 
 
259 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>