167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2729 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2729  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  531  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747307  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2896  hypothetical protein  77.04 
 
 
258 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.423093  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  70.04 
 
 
257 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  69.26 
 
 
257 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  69.65 
 
 
257 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  68.87 
 
 
257 aa  377  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  69.26 
 
 
257 aa  378  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  70.31 
 
 
256 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  69.26 
 
 
257 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  69.26 
 
 
257 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  68.75 
 
 
256 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1053  hypothetical protein  70.04 
 
 
257 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  68.48 
 
 
257 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  68.48 
 
 
257 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  66.93 
 
 
258 aa  368  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  68.09 
 
 
257 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  62.65 
 
 
258 aa  349  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  61.48 
 
 
289 aa  345  5e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1064  hypothetical protein  63.14 
 
 
259 aa  343  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1244  hypothetical protein  62.35 
 
 
259 aa  339  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4560  hypothetical protein  61.33 
 
 
259 aa  337  8e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  64.06 
 
 
257 aa  336  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1607  hypothetical protein  60.78 
 
 
259 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  60.31 
 
 
257 aa  334  7e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0896  hypothetical protein  60.94 
 
 
259 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453621  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1289  hypothetical protein  60.94 
 
 
259 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.657969  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0961  hypothetical protein  60.94 
 
 
259 aa  331  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4436  hypothetical protein  60.55 
 
 
259 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2547  hypothetical protein  60.7 
 
 
259 aa  328  8e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  59.92 
 
 
258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  59.92 
 
 
258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  59.92 
 
 
258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0006  hypothetical protein  59.14 
 
 
258 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  60.7 
 
 
257 aa  326  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0005  hypothetical protein  59.53 
 
 
258 aa  326  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18590  hypothetical protein  59.22 
 
 
259 aa  325  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0493865 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00006  hypothetical protein  59.14 
 
 
258 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3665  hypothetical protein  59.92 
 
 
257 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00006  hypothetical protein  59.14 
 
 
258 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3649  hypothetical protein  59.14 
 
 
258 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0007  hypothetical protein  59.14 
 
 
258 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.865833  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  61.09 
 
 
257 aa  325  6e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  60.94 
 
 
257 aa  324  7e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3590  protein of unknown function DUF328  58.75 
 
 
258 aa  323  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0007  hypothetical protein  58.75 
 
 
258 aa  324  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132956  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0006  hypothetical protein  58.75 
 
 
258 aa  323  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3860  hypothetical protein  58.75 
 
 
257 aa  320  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  58.75 
 
 
257 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  57.59 
 
 
259 aa  317  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  58.37 
 
 
257 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  58.37 
 
 
257 aa  315  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  58.37 
 
 
257 aa  315  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  58.37 
 
 
257 aa  315  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  58.75 
 
 
257 aa  316  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11220  hypothetical protein  57.65 
 
 
259 aa  315  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92361  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2499  hypothetical protein  58.75 
 
 
256 aa  312  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0568  hypothetical protein  56.81 
 
 
257 aa  307  9e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255606  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1032  hypothetical protein  57.03 
 
 
259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0536  protein of unknown function DUF328  56.03 
 
 
260 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2164  hypothetical protein  55.51 
 
 
257 aa  298  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0514757  normal  0.0821317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1840  hypothetical protein  55.51 
 
 
257 aa  298  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360763  normal  0.0166065 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0482  hypothetical protein  54.51 
 
 
258 aa  295  6e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.520329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  55.86 
 
 
260 aa  285  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  53.94 
 
 
257 aa  284  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0978  hypothetical protein  51.75 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  52.87 
 
 
261 aa  281  8.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1375  hypothetical protein  52.73 
 
 
260 aa  280  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508327  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  51.56 
 
 
260 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  53.91 
 
 
262 aa  279  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1650  hypothetical protein  55.08 
 
 
258 aa  278  6e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1611  hypothetical protein  52.34 
 
 
260 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2223  hypothetical protein  52.34 
 
 
260 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1467  hypothetical protein  52.73 
 
 
260 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000638991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1161  hypothetical protein  52.73 
 
 
260 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000956326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0708  hypothetical protein  52.73 
 
 
260 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1330  hypothetical protein  52.73 
 
 
260 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0444  hypothetical protein  52.73 
 
 
260 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1090  hypothetical protein  53.12 
 
 
260 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2247  hypothetical protein  51.95 
 
 
260 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1321  hypothetical protein  52.34 
 
 
260 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.522581  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2140  hypothetical protein  51.95 
 
 
260 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540337  normal  0.546865 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2261  hypothetical protein  52.34 
 
 
260 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1054  hypothetical protein  51.17 
 
 
260 aa  275  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00231161  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1014  hypothetical protein  51.36 
 
 
261 aa  274  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3180  hypothetical protein  51.56 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0791396  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  51.95 
 
 
260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3824  hypothetical protein  50.39 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  49.42 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2644  hypothetical protein  51.76 
 
 
262 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2372  hypothetical protein  51.56 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3291  hypothetical protein  51.37 
 
 
262 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5283  hypothetical protein  52.53 
 
 
261 aa  264  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0804357  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  50.19 
 
 
259 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  49.03 
 
 
258 aa  263  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2893  hypothetical protein  50.39 
 
 
257 aa  262  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3713  hypothetical protein  50.39 
 
 
258 aa  261  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0291165  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4789  hypothetical protein  51.76 
 
 
260 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.287151 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3166  hypothetical protein  49.61 
 
 
258 aa  255  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.819835  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2652  hypothetical protein  50.39 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0542  hypothetical protein  47.53 
 
 
266 aa  245  6e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0267663 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>