154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1568 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1568  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  526  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0239  hypothetical protein  51.42 
 
 		 251 aa  262  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000011533  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0493  hypothetical protein  46.12 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000635683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0431  protein of unknown function DUF328  44.98 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000242237 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04620  hypothetical protein  44.44 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.1961  hitchhiker  0.000000338147 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1764  hypothetical protein  41.46 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0121246 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2372  hypothetical protein  34.39 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3166  hypothetical protein  35.66 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.819835  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1244  hypothetical protein  34.23 
 
 		 259 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2119  hypothetical protein  34.65 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1064  hypothetical protein  34.63 
 
 		 259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  34.65 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0978  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2407  hypothetical protein  34.25 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  35.29 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2092  hypothetical protein  32.55 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.786423 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4436  hypothetical protein  34.36 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1289  hypothetical protein  34.36 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.657969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2261  hypothetical protein  32.68 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2140  hypothetical protein  32.68 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540337  normal  0.546865 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2499  hypothetical protein  35.66 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  30.38 
 
 		 259 aa  141  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  32.95 
 
 		 260 aa  141  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1650  hypothetical protein  34.98 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1090  hypothetical protein  33.72 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1467  hypothetical protein  33.2 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000638991  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3713  hypothetical protein  32.56 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0291165  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2652  hypothetical protein  32.31 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1161  hypothetical protein  33.2 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000956326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0708  hypothetical protein  33.2 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1321  hypothetical protein  33.2 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.522581  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1330  hypothetical protein  33.2 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0444  hypothetical protein  33.2 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82979  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4560  hypothetical protein  34.36 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  33.2 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1375  hypothetical protein  33.07 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508327  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  33.59 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  31.91 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0896  hypothetical protein  33.2 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  33.07 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  32.94 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  32.94 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0482  hypothetical protein  32.28 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.520329  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0828  hypothetical protein  32.95 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126561 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  32.17 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4789  hypothetical protein  32.55 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.287151 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  32.94 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  32.94 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1014  hypothetical protein  32.03 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  32.94 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0961  hypothetical protein  32.31 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2247  hypothetical protein  31.52 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  31.78 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1611  hypothetical protein  31.52 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2223  hypothetical protein  31.52 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  32.05 
 
 		 289 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  30.31 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1607  hypothetical protein  32.82 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2644  hypothetical protein  30.43 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  33.46 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  32.05 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1840  hypothetical protein  34.9 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360763  normal  0.0166065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3824  hypothetical protein  31.76 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  32.3 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  33.72 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2164  hypothetical protein  34.51 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0514757  normal  0.0821317 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  31.91 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1054  hypothetical protein  31.13 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00231161  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2893  hypothetical protein  34.48 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  32.3 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  32.3 
 
 		 257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2658  hypothetical protein  32.28 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  32.94 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3291  hypothetical protein  30.04 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1032  hypothetical protein  31.91 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  32.43 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3180  hypothetical protein  31.52 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0791396  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11220  hypothetical protein  32.82 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92361  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1317  hypothetical protein  31.64 
 
 		 257 aa  131  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18590  hypothetical protein  32.43 
 
 		 259 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0493865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1053  hypothetical protein  33.73 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  33.85 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  32.31 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  34.24 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4565  hypothetical protein  31.35 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.522206 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3590  protein of unknown function DUF328  31.76 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1320  hypothetical protein  31.76 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4480  hypothetical protein  31.1 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487032  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  33.46 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3665  hypothetical protein  33.59 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0006  hypothetical protein  31.76 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  34.98 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00006  hypothetical protein  31.76 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3649  hypothetical protein  31.76 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0006  hypothetical protein  31.76 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00006  hypothetical protein  31.76 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0007  hypothetical protein  31.76 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0007  hypothetical protein  31.76 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.865833  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2729  hypothetical protein  32.43 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1301  protein of unknown function DUF328  31.92 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>