158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1544 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1544  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  532  1e-150  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  34.63 
 
 
262 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  32.95 
 
 
257 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  32.95 
 
 
257 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  32.95 
 
 
257 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3824  hypothetical protein  30.77 
 
 
256 aa  122  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  32.95 
 
 
257 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  32.95 
 
 
257 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3665  hypothetical protein  31.25 
 
 
257 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1320  hypothetical protein  30.89 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1650  hypothetical protein  31.66 
 
 
258 aa  118  7.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2547  hypothetical protein  32.7 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1317  hypothetical protein  30.89 
 
 
257 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2499  hypothetical protein  30.23 
 
 
256 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3860  hypothetical protein  30.83 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  31.91 
 
 
267 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0482  hypothetical protein  29.34 
 
 
258 aa  115  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.520329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0536  protein of unknown function DUF328  32.31 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  31.4 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0005  hypothetical protein  31.52 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0568  hypothetical protein  29.3 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255606  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5283  hypothetical protein  32.95 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0804357  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  29.84 
 
 
260 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3590  protein of unknown function DUF328  31.66 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0444  hypothetical protein  34.01 
 
 
258 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  33.07 
 
 
252 aa  112  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0006  hypothetical protein  31.66 
 
 
258 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0006  hypothetical protein  31.66 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00006  hypothetical protein  31.66 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00006  hypothetical protein  31.66 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3649  hypothetical protein  31.66 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0007  hypothetical protein  31.66 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132956  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0007  hypothetical protein  31.66 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.865833  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  31.13 
 
 
257 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  32.43 
 
 
257 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4789  hypothetical protein  30.47 
 
 
260 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.287151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0239  hypothetical protein  29.53 
 
 
251 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000011533  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2893  hypothetical protein  29.18 
 
 
257 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4436  hypothetical protein  29.34 
 
 
259 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0554  hypothetical protein  28.95 
 
 
270 aa  105  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  29.73 
 
 
258 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0016  hypothetical protein  29.57 
 
 
257 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2652  hypothetical protein  30 
 
 
257 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08011  hypothetical protein  30.77 
 
 
254 aa  105  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0828  hypothetical protein  30.08 
 
 
263 aa  105  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  28.91 
 
 
260 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  29.23 
 
 
257 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  30.86 
 
 
289 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2164  hypothetical protein  31.66 
 
 
257 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0514757  normal  0.0821317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1054  hypothetical protein  27.63 
 
 
260 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00231161  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1289  hypothetical protein  29.34 
 
 
259 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.657969  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1467  hypothetical protein  29.34 
 
 
260 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000638991  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1358  hypothetical protein  29.57 
 
 
257 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3117  hypothetical protein  29.69 
 
 
257 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134852  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1161  hypothetical protein  29.34 
 
 
260 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000956326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0708  hypothetical protein  29.34 
 
 
260 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0026  hypothetical protein  29.57 
 
 
257 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.234225  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1321  hypothetical protein  29.34 
 
 
260 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.522581  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1330  hypothetical protein  29.34 
 
 
260 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0444  hypothetical protein  29.34 
 
 
260 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82979  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0637  hypothetical protein  29.74 
 
 
270 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000248994  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1607  hypothetical protein  29.34 
 
 
259 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  31.15 
 
 
257 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0978  hypothetical protein  30.27 
 
 
261 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  28.85 
 
 
257 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4560  hypothetical protein  30.08 
 
 
259 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  28.08 
 
 
257 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2247  hypothetical protein  28.19 
 
 
260 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  30.12 
 
 
258 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1840  hypothetical protein  31.15 
 
 
257 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360763  normal  0.0166065 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  28.85 
 
 
257 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  30.12 
 
 
258 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  30.12 
 
 
258 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0896  hypothetical protein  28.96 
 
 
259 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453621  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2140  hypothetical protein  28.85 
 
 
260 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540337  normal  0.546865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18590  hypothetical protein  28.96 
 
 
259 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0493865 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0542  hypothetical protein  28.41 
 
 
266 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  28.68 
 
 
256 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  28.68 
 
 
257 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3180  hypothetical protein  29.66 
 
 
260 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0791396  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  28.85 
 
 
257 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4565  hypothetical protein  31.27 
 
 
253 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.522206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1611  hypothetical protein  27.8 
 
 
260 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2896  hypothetical protein  28.85 
 
 
258 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.423093  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2261  hypothetical protein  28.85 
 
 
260 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2223  hypothetical protein  27.8 
 
 
260 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  28.29 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  27.8 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1090  hypothetical protein  28.96 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2407  hypothetical protein  27.03 
 
 
254 aa  99.4  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2119  hypothetical protein  27.41 
 
 
254 aa  99.4  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  29.23 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1014  hypothetical protein  29.5 
 
 
261 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2658  hypothetical protein  31.25 
 
 
251 aa  99  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3166  hypothetical protein  31.03 
 
 
258 aa  98.6  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.819835  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0961  hypothetical protein  27.8 
 
 
259 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  28.96 
 
 
257 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4480  hypothetical protein  29.18 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487032  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  29.69 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3713  hypothetical protein  29.73 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0291165  normal  0.238591 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>