166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1834 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  100 
 
 
266 aa  501  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  56.06 
 
 
258 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  61.07 
 
 
277 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  58.05 
 
 
254 aa  224  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  55.7 
 
 
254 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  59.09 
 
 
260 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  52.1 
 
 
263 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  53.05 
 
 
247 aa  191  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  51.94 
 
 
265 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  35.94 
 
 
279 aa  153  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  49.55 
 
 
265 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  50.23 
 
 
252 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  46.44 
 
 
251 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  46.73 
 
 
246 aa  141  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  47.83 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  48.07 
 
 
248 aa  135  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  44.17 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  48.26 
 
 
248 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  48.26 
 
 
248 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  43.36 
 
 
248 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  42.29 
 
 
248 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  43.7 
 
 
246 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  42.04 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  41.44 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  44.89 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  43.75 
 
 
249 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  39.17 
 
 
252 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  39.66 
 
 
255 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  42.41 
 
 
279 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  42.53 
 
 
252 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  42.66 
 
 
232 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  39.83 
 
 
248 aa  79  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  28.52 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  23.33 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0604  protein of unknown function DUF328  23.38 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0200357  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  22.27 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1375  hypothetical protein  27.27 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508327  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  22.38 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  22.12 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2652  hypothetical protein  30.17 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3180  hypothetical protein  27.09 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0791396  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  28.39 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  25.43 
 
 
247 aa  62.4  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  27.54 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2140  hypothetical protein  27.53 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540337  normal  0.546865 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2261  hypothetical protein  27.53 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2092  hypothetical protein  32 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.786423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1611  hypothetical protein  26.52 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2223  hypothetical protein  26.52 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2247  hypothetical protein  26.52 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  25.44 
 
 
258 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  26.38 
 
 
258 aa  60.1  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4789  hypothetical protein  28.63 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.287151 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  23.61 
 
 
245 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  26.28 
 
 
257 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  26.27 
 
 
258 aa  58.9  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  25.97 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  25.97 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  25.97 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  26.36 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1054  hypothetical protein  25.9 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00231161  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0542  hypothetical protein  21.98 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  26.58 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  28.85 
 
 
259 aa  57.4  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1014  hypothetical protein  26.84 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0444  hypothetical protein  29.94 
 
 
258 aa  56.6  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  31.01 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  25.95 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1090  hypothetical protein  27.31 
 
 
260 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11743  predicted protein  27.92 
 
 
264 aa  55.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.555211  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3713  hypothetical protein  26.55 
 
 
258 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0291165  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  25 
 
 
289 aa  55.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1358  hypothetical protein  30.51 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2164  hypothetical protein  25.86 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0514757  normal  0.0821317 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2658  hypothetical protein  28.72 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  24.51 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  29.8 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5283  hypothetical protein  27.02 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0804357  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1467  hypothetical protein  27.35 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000638991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1161  hypothetical protein  27.35 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000956326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0708  hypothetical protein  27.35 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0026  hypothetical protein  32.63 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.234225  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1330  hypothetical protein  27.35 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0444  hypothetical protein  27.35 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82979  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  26.97 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1840  hypothetical protein  25.86 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360763  normal  0.0166065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  27.7 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  30.2 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1321  hypothetical protein  27.12 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.522581  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  25.23 
 
 
258 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0016  hypothetical protein  32.91 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4565  hypothetical protein  32.65 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.522206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  28.48 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3143  hypothetical protein  26.35 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000248276  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  23.58 
 
 
257 aa  53.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  26.45 
 
 
256 aa  52.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  27.03 
 
 
257 aa  52.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0978  hypothetical protein  27 
 
 
261 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  25.88 
 
 
257 aa  52  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  30.06 
 
 
267 aa  52  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>